有多种因素影响机体对抗原免疫应答的类型及强度，但主要取决于
抗原物质本身的性质及其与机体的相互作用。影响抗原诱导免疫应答的因素可概述为以下三个方面。
一、抗原分子的理化性质
1．化学性质 天然抗原多为大分子有机物。一般蛋白质是良好的抗原。糖蛋白、脂蛋白和多糖类、
脂多糖都有免疫原性。脂类和
哺乳动物的细胞核成分如DNA、组蛋白一般难以诱导免疫应答。但细胞在某些状态下如肿瘤或过活化时，其染色质、DNA和组蛋白都具有免疫原性，能诱导相应的自身抗体生成。
2．分子量大小 抗原的分子量一般在10千道尔顿（kD）以上，一般来说，抗原的分子量越大，含有抗原表位越多，结构越复杂，免疫原性越强。大于100kD的为强抗原，小于10kD的通常免疫原性较弱，甚至无免疫原性。
3．结构的复杂性 分子量大小并非决定免疫原性的绝对因素。明胶分子量为100kD，但免疫原性却很弱，原因在于明胶是由直链氨基酸组成，缺乏含
苯环的氨基酸，稳定性差。如在明胶分子中接上2％的
酪氨酸后，其免疫原性大大增强。
胰岛素分子量仅5.7kD，但其序列中含芳香族氨基酸，其免疫原性较强。
4．分子构象（conformation） 某些抗原分子在天然状态下可诱生特异性抗体，但经变性改变构象后，却失去了诱生同样抗体的能力。这是由于其构象表位改变的缘故。因此，抗原分子的空间构象很大程度上影响抗原的免疫原性。
5．易接近性（accessibility） 是指抗原表位能否被淋巴细胞抗原受体所接近的程度。抗原分子中氨基酸残基所处侧链位置的不同可影响抗原与淋巴细胞抗原受体的结合, 从而影响抗原的免疫原性。如图3－2所示，氨基酸残基在侧链的位置不同（A与B相比），其免疫原性也不同；B与C相比，因侧链间距不同，使BCR可接近性不同，故免疫原性也不同。
6．物理状态 一般聚合状态的蛋白质较其单体有更强的免疫原性；颗粒性抗原的免疫原性强于可溶性抗原。因此常将免疫原性弱的物质吸附在某些大颗粒表面，可增强其免疫原性。
二、宿主方面的因素
1．遗传因素 机体对抗原的应答是受遗传（基因）控制的。研究发现，不同遗传背景的小鼠对特定抗原的应答能力不同，对某一抗原呈高反应的小鼠品系对其他抗原可能呈低反应性。不同遗传背景的
豚鼠对白喉杆菌的抵抗力各异，且有遗传性。多糖抗原对人和小鼠具有免疫原性，而对豚鼠则无免疫原性。个体遗传基因不同，对同一抗原的免疫应答与否及应答的程度不同。在诸多遗传因素中，MHC是控制个体免疫应答质和量的关键因素。
2．年龄、性别与健康状态 一般说青壮年动物比幼年和老年动物对抗原的免疫应答强；新生动物或婴儿对多
糖类抗原不应答，故易引起细菌感染。雌性比雄性动物抗体生成高，但怀孕动物的应答能力受到显著抑制。感染或
免疫抑制剂都能干扰和抑制机体对抗原的应答。
三、抗原进入机体方式的影响
抗原进入机体的数量、途径、次数、两次免疫间的间隔时间以及免疫佐剂的应用和佐剂类型等都明显影响机体对抗原的应答。一般而言抗原剂量要适中，太低和太高则可诱导免疫耐受。免疫途径以皮内免疫最佳，皮下免疫次之，腹腔注射和
静脉注射免疫效果相对较差，口服易诱导耐受。注射间隔时间要适当，次数不要太频。要选择好免疫佐剂，弗氏佐剂主要诱导IgG类抗体产生，
明矾佐剂易诱导IgE类抗体产生。