交通运输局综合行政执法局和交通局（现均已改称为交通运输局）就是上下级隶属关系。交通局（即交通运输局）是交通运输局综合行政执法局的上级主管部门，而交通运输局综合行政执法局是交通局（即交通运输局）的一个直属单位，对内是接受交通局（即交通运输局）的领导与管辖，对外也是代表交通局（即交通运输局）的，机构级格一般就是两级局，即一个副局级单位。
交通运输局综合行政执法局的主要职责包括：
（一）贯彻执行国家、省和市有关交通运输工作的方针、政策和法律法规，拟订辖区内交通行政执法工作规划，并组织实施。
（二）负责辖区范围内的公路运政、水路运政、公路（含高速公路）路政、港口行政、航道行政、交通规费稽查等方面的行政执法工作。
（三）负责辖区范围内对公民、法人、其他组织遵守交通行政管理法律、法规、规章的情况进行监督检查，依法纠正和查处违法违规行为，并对违反交通行政管理秩序的行为实施行政处罚。
（四）统筹组织、指挥协调辖区内交通行业的专项整治，查处违法案件，协调跨区域交通行政执法工作。
（五）承担法律、法规规定的其他相关的行政处罚、行政强制及监督检查职能。
（六）承办当地党委、政府和上级有关部门交办的其他事项。
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