三江地区白垩纪岩浆活动与白垩纪特提斯构造域演化密切相关，可大致划分为早白垩世和晚白垩世始新世两个阶段。早白垩世岩浆活动主要发育于雅鲁藏布江洋脊，以基性超基性岩浆的喷溢和侵入活动为主，是海底扩张作用的产物。晚白垩世—始新世发育于冈底斯陆缘弧的中酸性岩浆的喷出和侵入活动，是洋壳俯冲作用的产物，形成了冈底斯中酸性岩带；发育于藏中弧后盆地的中酸性岩浆侵入活动，是陆内会聚作用的产物，形成了班戈－嘉黎花岗岩带；发育于冈底斯陆缘弧和藏中弧后盆地间的铁质基性超基性岩带以及叠加于他念他翁褶皱带和昌台－乡城岛弧和义敦弧后盆地褶皱带的晚白垩世始新世中酸性岩浆活动所形成的类乌齐－耿马花岗岩带和雀儿山－格聂花岗岩带，亦是陆－陆碰撞造山作用的产物，与相应的断裂活动有关。
早白垩世海底扩张时期于雅鲁藏布江洋脊形成的基性熔岩及其下可能存在的堆晶基性超基性杂岩、镁质超基性岩，通过晚白垩世—始新世的洋壳俯冲大部分已被消减，仅有少部分于晚白垩世—始新世以来的陆－陆碰撞时期以构造侵位形式分布于板块结合带，形成雅鲁藏布江蛇绿岩带。
波密腾冲花岗岩带是晚白垩世—始新世洋壳俯冲作用形成的冈底斯花岗岩带以及与陆内汇聚作用有关的班戈－嘉黎花岗岩带的东南延伸部分。波密、察隅地区的花岗岩与冈底斯花岗岩较为相似，而腾冲、梁河地区的花岗岩与班戈嘉黎花岗岩比较接近。