植物源
秸秆类：常见的原有玉米秸秆、小麦秸秆、豆秸秆、水稻秸秆。含有高的纤维素和木质素等大分子物质，氮磷钾等养分含量较低（除豆科类），单独用这类物料做有机肥的罕见，一般用来增加发酵物料的有机质，调节碳氮比。这类原料比较丰富，价格低廉，但因这些物料多存在农业从事散户手中，大面积收购比较困难，且季节性较强，全年生产需提前备货。
粕类：有豆粕、棉粕、蓖麻粕、花椒粕、花生粕等多为农产品加工产业的下脚料，多为辅料。粕类为原料的有机肥可称得上为高端有机肥，因其多为饲料级，原料成本较高，发酵腐熟不宜控制。
菌糠：俗称蘑菇渣，金针菇渣、平菇渣、杏鲍菇渣等，原料多为酒糟、玉米芯、稻壳粉、麦麸、豆粕及配一些营养元素。菌糠有机质高、富含菌体蛋白、维生素、微量元素及生长素，做有机肥在肥力效果较好。
动物源
动物粪便：羊粪、猪粪、牛粪等都是比较好的有机肥原料。有机质含量高，但由于纤维含量少不易分解。使用时要经过充分腐熟发酵，高温杀灭病虫卵、菌和杂草种子。
动物加工废弃物：加工废弃物，甚至是养殖废弃物等也能成为有机肥的原料。通常采用的是无公害生物降解法。
对露地花木而言，可选的肥料种类较多，具体可分为有机肥和无机肥。
（1）有机肥
有机肥来源广泛，如各种堆肥、厩肥、饼肥、鱼粉、骨粉、屠宰场废料及制糖残渣等。有机肥富含有机质，营养元素含量丰富，有效性高，但由于肥效慢，常作基肥施用，但以腐熟为宜，有效成分作用时间长，即使无效成分也有改良土壤理化性质的作用，如提高土壤疏松度、加速土肥融合、改善土壤中的水、肥、气、热等的状况，另外有机肥可以提高许多难溶性营养元素，如钙、镁等的有效性，延长元素的供应期。一些特殊的有机肥，如沼气池经充分发酵溢出的沼液也可以用作叶面喷肥。
近年来，还出现了一些新型有机肥料，如垃圾堆肥，它是城市垃圾经粉碎堆沤而制成的一类有机肥料，其有机质含量高，但腐殖质水平较低，全磷含量高，而有效磷含量低，且含有较大比例的砾石成分，长期施用于大田会导致土壤沙化，使用量应控制在16千克/米2以下。另一种有机肥料是果酒厂及制糖厂的终产废弃物——果渣或蔗渣，经高温发酵后，可直接应用于大田或盆栽。
（2）无机肥
肥效高，常为有机肥的10倍以上，营养元素含量单一，肥效期短，生产中常用的无机肥料主要有尿素、氯化钾、硫酸铵、过磷酸钙等，另外还有许多的多元复合肥料，如过磷酸镁铵、磷酸二铵、磷酸二氢钾等。
今年来，针对无机肥料肥效期短的缺点，研究者开发出了许多新型无机肥料，如甲醛尿素，只有在细菌的作用下，氮才能慢慢释放出来，肥效期长达2年。另外，缓释肥技术今年的研究也较为深入，国内已有厂家生产。这种缓释肥不怕水分淋溶，肥效持久，有效性好，肥效期长达3～16个月，完全可以满足花卉生长的需要。
稀土肥料也是一种较为新型的无机肥料，它不但应用广泛，效果显著，而且对植物中农药残留毒性有降解作用，有利于净化、保护生态环境，稀土肥料处理花卉后，还能使花卉产生荧光，增强观赏价值。
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