这个保证金是由施工方交纳的。
国家只是规定需要交纳农民工的保证金，但是交纳比例每个地区都略微不同，具体数目由各地的政府决定。下面是某地区关于农民工的保证金交纳比例的规定。
退取农民工工资保证金应提供的资料。
1、法定代表人授权委托书；
2、退款人身份证原件及复印件；
3、建设工程验收合格意见书原件及复印件；
4、务工人员工资发放花名册（工程竣工最后三个月）；
5、缴纳保证金发票原件及复印件；
6、退款前一个月“结清务工人员工资通告”的照片（通告应张贴在工程地醒目位置公示一个月以上，并注明绥阳县劳动保障监察大队投诉电话）；
7、工程期间的劳动用工合同或每月用工登记台帐；
8、建筑企业要求退取务工人员工资保证金的申请。工程竣工验收合格60日后，建筑企业可以申请退还务工人员工资支付保证金。 农民工工资保证金，是指在工程开工之前，由建设工程项目审批行政部门负责通知，并监督建设单位按照工程合同价款的3%向银行专户存储的工资专项资金。保证金根据省、市、县各级项目审批权限实行层级监管，并实行专户存储、专项支取，任何单位和个人不得挪用。
【法律依据】
农民工
一、四种情况下可支取保证金
有下列四种情形之一时，经劳动保障部门查证属实后可以支取保证金：建设企业未依法及时结算农民工工资，拖欠农民工工资的；建设单位或建设企业非法转包、分包建设工程，导致用工主体不具有法人资格而发生拖欠农民工工资行为的；建设单位或建设企业法人代表或工程负责人隐匿逃跑或死亡，造成拖欠农民工工资的；其他被认为拖欠农民工工资的。工程交工后，建设单位在施工现场农民工集散场所公示本建设项目的竣工日期、工资结算结果等情况，公示时间不得少于15个工作日。凡无拖欠的，由银行将保证金本金及活期利息一次性退还缴费单位。
二、及时补缴建设项目要停工
启用保证金支付农民工工资后，劳动部门将责令责任单位在30日内等额补缴已启动支付的保证金。逾期未补缴的，建设工程项目部门对在建工程予以停工，已竣工项目不予验收。同时，建设工程项目审批部门和劳动保障部门将责任单位记入信用档案，通报批评并向社会曝光；情节严重的，依法予以处罚。
三、 农民工工资保证金由谁缴纳？
1、办理施工许可证是甲方负责办理的，其中有一条就是民工工资保证金的凭证的事。所以是甲方办理。
2、然后甲方再把这笔钱从施工总包单位身上扣下来。就变成是施工单位自己交的了啊。一般合同中会约定的。
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