南京林业大学拥有园林、林产化工、木材科学与工程、机械设计制造及其自动化、农林经济管理、森林工程，生态学，风景园林学，轻工技术与工程等王牌专业。
国家级特色专业：园林、林产化工、木材科学与工程、机械设计制造及其自动化、农林经济管理、森林工程
省级品牌特色专业：轻化工程、木材科学与工程、林学、艺术设计、机械设计制造及其自动化、土木工程（品牌）、林产化工（品牌）、园林、工商管理、农林经济管理、森林工程、林产化工（特色）、工程管理、交通工程、工业设计、土木工程（特色）
江苏高校品牌专业：林学、园林、木材科学与工程、林产化工
江苏重点建设学科
世界一流学科建设学科：林业工程
一级学科国家重点学科：林业工程、生态学
二级学科国家重点学科：林木遗传育种、林产化学加工工程、木材科学与技术、森林保护学
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