根据上述职责，自治区人民政府办公厅设有18个内设机构。（一）主席办公室。负责自治区主席的政务活动、外事活动的安排，以及自治区副主席、秘书长的相关安排。处理自治区主席的文电、信函、批示，协调确保主席批示和指示的落实，并组织起草重要材料和文件。负责会议的会务工作，编写会议简报和纪要，以及信息收集和编发工作。（二）综合处。处理厅机关的政务、事务工作，负责领导同志的政务活动、外事活动的安排，办理相关文电处理工作，以及来信来访的处理。（三）第一秘书处。办理监察、财政、人力资源和社会保障、审计、国资监管、税务、法制、金融、招标投标管理、机构编制、机关事务管理、驻外办事处、档案、保密等方面的文电工作。（四）第二秘书处。办理工业和信息化（中小企业）、交通运输、铁路、航空、安全生产、煤监、交通战备、工会、工商联、烟草、黄金管理、储备物资管理、电力、石化、通信管理、邮政管理等方面的文电工作。（五）第三秘书处。办理发展改革、物价、国土资源、测绘、海洋、地矿、环保、统计等方面的文电工作。（六）第四秘书处。办理科技（知识产权）、水利、农业、林业、农垦、粮食、扶贫、供销、水产畜牧兽医、农业区划、农机、自然科学、科协、地震、气象等方面的文电工作。（七）第五秘书处。办理商务（口岸）、外事、质量监督、港澳台侨、广西北部湾经济区开放开发、国际博览事务、保税物流、打私综合治理、贸易促进、检验检疫、海关、海事等方面的文电工作。（八）第六秘书处。办理民族（少数民族语言文字）、民政（老龄）、住房和城乡建设、工商管理、旅游、人防、投资促进、水库移民、宗教、残疾人工作等方面的文电工作。（九）第七秘书处。办理教育、文化、卫生、人口计生、广电、新闻出版、体育、食品药品监管、社会科学、地方志编纂、政府参事、文史、妇女儿童以及红十字等方面的文电工作。（十）第八秘书处。办理公安、国家安全、司法、监狱、劳教、信访、三大纠纷调处、边海防，以及法院、检察院、军队、国防等方面的文电工作。（十一）文电处。负责文电收发、运转、印鉴管理、文书档案、保密、文印、公文规范审核、机要通信、文件交换等方面的工作。（十二）信息处（广西壮族自治区人民政府公报室）。负责指导全区政府系统政务信息工作，编辑政务信息，向国务院和自治区人民政府领导同志报送信息，指导电子政务工作，办理相关的文电和督查工作。（十三）人事处。负责厅机关及直属单位、自治区人民政府驻外办事处的人事管理、机构编制、教育培训和出国政审工作。（十四）接待处。负责大型会议和接待工作，以及中央和自治区领导同志的接待等工作。（十五）行政财务处。负责后勤服务管理工作，以及财务、国有资产管理等工作。（十六）自治区人民政府督查室。负责督查重要决策和部署的执行情况，办理建议和提案，指导全区政府系统的督查工作。（十七）自治区人民政府应急管理办公室（自治区人民政府总值班室）。负责应急管理、督查和值班等工作，指导全区应急管理工作。（十八）自治区政务服务中心管理办公室（自治区政务公开领导小组办公室、自治区政府信息公开领导小组办公室）。负责行政审批和政务服务管理，指导全区行政审批和政务服务中心管理工作。机关党委负责党群工作，离退休人员工作处负责离退休人员的工作。
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