海南自贸港税收制度或主要涉及关税及所得税，或暂不会涉及消费税及增值税。
中国内陆地区的增值税和消费税都是国内税务大头。
消费税为流税中的仅次于增值税的第二税种，进出口的销售增值税税率为13%，国家在海南地区对于消费税和增值税的免征，对于海南来说无疑是一个很好的自贸环境。税收优惠，国家大力支持发展。
2018 年 12 月 5 日 海南省副省长沈丹阳 随着探索建设中国特色自贸港进程的加快，海南或将分步骤、分阶段实行零关税和低所得税等 政策，进一步降低企业成本。
2019 年 2 月 5 日 海南省财政厅负责 人 未来，海南进口的物品和原料有望实现零关税，从而实现日常消费全岛免税。目前，财政部门正 配合海南省委省政府规划、推动自贸港财税制度的设计和论证。
2019 年 7 月 5 日 海南省财政厅党组 书记、厅长王惠平 探索试行自由贸易港财税政策，在部分行业和园区压茬试行零关税和低税率，形成具有国际竞 争力的财税政策制度，打造与国际接轨的一流营商环境。
2019 年 9 月 2 日 海南省副省长沈丹 阳 立足贸易自由化便利化和投资自由化便利化，对标世界最高水平开放形态，以适当方式实施世 界各地自贸港普遍实施的包括“零关税、低税率、简税制、更自由”在内的政策和制度
2019 年 12 月 26 日 海南国际经济发展 局副局长姬国辉 未来海南自贸港政策可期。目前有两点可以形成共识：一是海南要做全世界最开放的自由贸易 港。二是‘三税三自由’，即零关税、简税制、低税率和人员、货物、资金跨境自由流动。
2020 年 1 月 6 日 海南省反走私暂行 条例 严禁利用国家给予本省的关税优惠政策和便利条件进行走私违法犯罪活动。
2020 年 2 月 3 日 省委自由贸易试验 区(自由贸易港)工 作委员会办公室副 主任周军平 目前洋浦已启动零关税、低税率和海关监管创新 3 个课题，聘请专家智库协助研究。