1992年～1997年间连载。共19个长篇事件，27册单行本。
1、歌剧院杀人事件
2、异人馆村杀人事件
3、雪夜叉传说杀人事件
4、学园七个不可思议杀人事件
5、秘宝岛杀人事件
6、悲恋湖传说杀人事件
7、异人馆旅馆杀人事件
8、绞首学园杀人事件
9、飞驒机关宅邸杀人事件
10、金田一少年之杀人
11、塔罗牌山庄杀人事件
12、蜡像城人形杀人事件
13、怪盗绅士的杀人
14、墓场岛杀人事件
15、魔术列车杀人事件
16、黑死蝶杀人事件
17、法兰西银币杀人事件
18、魔神遗迹杀人事件
19、速水玲香诱拐杀人事件 1998年～2001年间连载。共7个长篇事件，10册单行本。
20、魔犬森林杀人事件
21、银幕之杀人鬼
22、天草财宝传说杀人事件
23、雪影村杀人事件
24、露西亚人形杀人事件
25、怪奇马戏团杀人事件
26、金田一少年敢死之行 1997年～2000年间连载。共17个短篇事件7个超短篇事件，6册单行本。
短篇
01 冰点下15度的杀意
02 是谁杀了女神?
03 1/2的杀人者
04 圣诞夜杀人事件
05 镜迷宫杀人事件
06 金田一二三绑架事件
07 金田一二三的冒险
08 消失在雪地里的赎金
09 底片里的不在场证明
10 杀人餐厅
11 染血之泳池杀人事件
12 亡灵学校杀人事件
13 瞬间消失之谜
14 妖刀毒蜂杀人事件
15 怪盗绅士的挑战书
16 凌晨04:40的枪声
17 女医师的诡异企图
超短篇
01 美雪和阿一的生活琐事
02 K M R
03 金田一少年之报酬
04 金田一少年之怪奇事件簿
05 美少女侦探 金田一二三
06 美少女侦探 金田一二三2
07 美少女侦探 金田一二三3 1997年～2000年间连载。共7个短篇事件2个超短篇，2册单行本。
短篇
01 证词猜谜 The Murder Train
02 杀人扑克 Unlucky Men in the Rain
03 死者的将军棋 The Great Chess Player Akechi
04 幽灵饭店杀人事件 The Encounter
05 明智少年之最初事件 Farewell,My Dear Friend
06 杀意四重奏 The Perfect Violinist Akechi
07 幽灵剑客杀人事件 The Pride Murder
超短篇
01 健悟的房间
02 明智警视优雅的早晨情景
