一、全国英语等级考试与大学英语等级考试的主办机构不同
PETS是由国家教育部考试中心举办，而CET是由国家教育部高等教育司组织。
二、全国英语等级考试报名要比大学英语等级考试的条件宽松很多
1、考生范围 从考生的背景来说PETS是真正的"全国性"考试，因为它对考生没有任何年龄、职业和教育程度的限制，任何人都可以参加，甚至还没有年满18岁的考生同样 可以报名;而CET是大学英语考试，因此该考试主要是针对在校大学生的，尽管从1994年以来，社会考生也被允许参加四、六级考试，但要求报考四级的考生 至少具备大学专科学历。
2、考试的等级划分 :PETS考试分为五级，但考生不必按部就班从一级考起，可以根据自己的情况参加任何一级的考试;但CET的规定就要严格的多，如果考生没有通过四级的话是不允许参加六级考试的，而且按最新的规定如果考生没有大学专科毕业证，报考四级就必须有CET三级证书。
三、全国英语等级考试和大学英语等级考试构成有所不同：这方面的区别主要体现在口语考试的问题上。众所周知，口语考试是PETS考试中的一部分，考生必须参加，而想要得到PETS等级证书必须笔试和口试都及 格，两者缺一不可。
但CET考试的情况就不同了，口语考试只面向那些四级成绩达到80分，六级成绩达到75分的优秀考生，因此其考生范围相当小。从严格意义上来说口语考试并不是CET四六级考试的一部分，它单独考试，单独计分，单独颁发证书，它的成绩对考生得到四六级证书是没有影响的。
四、全国英语等级考试和大学英语等级考试成绩的用途不同：
在此所指的用途不同当然不是指在应聘工作时的差别，而是指对考生其他学习的影响。参加高自考的考生如果有PETS二 级考试的成绩，就可以替代高自考大专的英语成绩，如果有PETS三级成绩可以替代高自考本科的英语成绩，而PETS五级考试可以替代申请公费出国留学的EPT考试成绩。 大学英语四、六级考试的成绩主要是对在校大学生有着直接的影响。
五、全国英语等级考试没有考试对象的限制，大学英语等级考试要在校大学生才可以考
六、全国英语等级考试有口语考试与证书，大学英语等级考试没有证书，只有成绩单。全国英语等级考试可以代替一些证书和一些考试，大学英语等级考试不可以。
七、全国英语等级考试的口语与笔试的单科成绩可以保留到下一次考试。也就是说你可以考二次，只要两门都过了就可以拿到证书。大学英语等级考试不可以。
八、全国英语等级考试可以跨级考，而大学英语等级考试非得你过了四级才可以考六级。
参考资料来源：百度百科-大学英语四六级考试
参考资料来源：百度百科-全国英语等级考试