嘉善中学坚持教学为中心,面向全体学生全面推行素质教育以新课程改革为契机,以提高课堂教学效益为重点,以教科研为突破口,全面提高教学质量。取得了一定的成绩。高中教学在生源较差的情况下,奋力拼搏,教学质量不断攀升。
会考合格率均稳定在96%以上,有的学科合格率甚至达到100%,AB率在普通完高中的平均水平之上。2005届已完成会考的学科合格率达99.56%,优秀率为61.78%;2006届已完成会考的学科合格率达100%,优秀率达76.67%。
学生参加省、市、县学科竞赛也连连获奖。在2001年全国首届高中生物学联赛中,该校胡明明获全国三等奖。在2001年全国“希望杯”数学竞赛中,金一轩获全国三等奖。在2002年全国高中生化学竞赛中,该校殷利、张家恺获省二等奖。在2003年省第七届高中生物竞赛中,朱晓峰获省一等奖,省中学生物理竞赛中孔维良获省三等奖。2004年省第八届高中生物学竞赛中陈骁杰获省二等奖。2002年—2004年有119人获市级一、二、三等奖。