在序列比对的过程中,常常需要将核苷酸序列转换为
氨基酸序列,比对氨基酸是否有所突变。方法有很多,我常用的一种是通过SnapGene软件转换。操作如下:
1.需要准备一条目的基因序列(fasta格式),通过SnapGene软件打开。点击Map选项卡,选中CDS的区域(如果这个文件为cds序列,则全部选中;若cds是片段,则选中cds的片段部分)
2.点击上方feature-Add feature,给CDS区域加上feature;
3.设置feature,点击Type-CDS-OK,设置完毕;
4.点击Action-Make protein,得到氨基酸序列;
5.点击Sequence即是需要氨基酸的序列,可以保存为prot文件,也可以复制保存为fasta格式文件