如何使用SnapGene将DNA序列转换为氨基酸序列

如题所述

在序列比对的过程中,常常需要将核苷酸序列转换为氨基酸序列,比对氨基酸是否有所突变。方法有很多,我常用的一种是通过SnapGene软件转换。操作如下:

1.需要准备一条目的基因序列(fasta格式),通过SnapGene软件打开。点击Map选项卡,选中CDS的区域(如果这个文件为cds序列,则全部选中;若cds是片段,则选中cds的片段部分)

2.点击上方feature-Add feature,给CDS区域加上feature;

3.设置feature,点击Type-CDS-OK,设置完毕;

4.点击Action-Make protein,得到氨基酸序列;

5.点击Sequence即是需要氨基酸的序列,可以保存为prot文件,也可以复制保存为fasta格式文件
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