长期饮用会有害，但偶尔家里停水，用来做饭，偶尔烧开水喝也不会有太大影响。
太阳热水器加热的水温一般在40度至70度之间，适应病菌、病毒的大量繁殖。再加上太阳能里的水往往又是隔夜的，由于长时间滞留和温度的影响，水里起消毒作用的氯会逐渐减少甚至消失，更促进储水箱和管道里水中微生物和细菌的增长。
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水垢胶结时，也常常会附着大量重金属离子，如果该容器用于盛装饮用水，会有重金属离子过多溶于饮水的风险。
水垢碎片进入胃中会与盐酸反应，释放出钙镁离子和二氧化碳，前者是结石形成的必要物质。后者则会使人胀气、难受，胃溃疡病人还可能发生胃穿孔的危险。
热水器里的水即使达到了100度，加热时间也是很长的，在此过程中，会有很多亚硝酸盐生成，而亚硝酸盐则是威胁人类健康的主要杀手，家庭中的二次蒸馏水专家都不建议饮用。
参考资料来源：人民网-经常喝四种水等于慢性自杀
太阳能热水器的水多数属于二次加温，主要是因为热水器长年使用，有一部分是陈水(即没用完的水)，会有污垢积存，其中的有害物质是非常多的。
此外，热水器里的水即使达到了100度，加热时间也是很长的，在此过程中，会有很多亚硝酸盐生成，而亚硝酸盐则是威胁人类健康的主要杀手，家庭中的二次蒸馏水专家都不建议饮用。
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水垢对人体的危害：
水中的钙、镁离子被医学界称为人体的保护性元素，它能抵御损害健康的有关元素的侵袭。如高氟水源地区氟中毒的形成就与钙、镁离子有关，含钙、镁离子少的地区的人群容易发生氟中毒，而含钙、镁离子多的地区则不易发生氟中毒。
克山病、大骨节病等病因很复杂，但水中缺少钙、镁离子也是重要原因之一，预防这些疾病的措施之一就是提高水的硬度（增加钙镁离子含量）。国内外也有不少报道:软水区（水中钙镁离子较少）的心血管病患者明显高于硬水区人群的患病率。
目前国际上很多国家研究发现热带地区因饮用的是地表水，水相对较软（水中钙镁离子较少）。所以热带地区的人成长发育的结果就是比较矮小，免疫系统容易被攻击。而饮用水硬度相对较高的地区（水中钙镁离子较多），人发育的都比较健壮，对疾病的免疫力也比较强。而且海岛上的人如果长期饮用雨水会造成肌肉萎缩。
参考资料来源：凤凰网―热水器里的水，千万不能喝
本回答被网友采纳疾病预防控制中心:太阳能热水器水箱里的水不经常流动,水里杂质和锈铁较多,喝了对身体有影响,最好不要喝。
-- 作者： 黄蜂
-- 发布时间： 2006/06/27 08:38pm
太阳能热水器水箱内胆,一般采用SUS3042B的食品级不锈钢,也就是做不锈钢饭盒的材料,如果是正规厂家的热水器产品,能确保用的是食品钢的话,饮用没问题,这是对水箱内胆来说;其次是真空管,一般是全玻璃真空管,直插式的,构造如同暖瓶胆,真空镀层在最内层玻璃的相对面,与水是隔绝的,和暖瓶的保温原理一样,所以对于真空管来说对水没污染,可以饮用;然后就是真空管与水箱相接的地方用来密封用的硅胶圈,材料与医用装生理盐水和葡萄糖的瓶子塞类似,就是挂点滴用的那种瓶子,所以对水也不会产生污染.一般在夏天甚至春末或秋初,热水器中的水很容易就能被加热至沸腾,理论上讲,太阳能热水器里的水是可以饮用的。
但有几点要注意:1、不是直插式的要注意，比如是承压热水器，多数是阳台壁挂式的，因为采用紫铜管做承压循环水路，会有铜绿产生，对人体健康有影响；2、由于成本原因，许多小一些的太阳能厂家在用料上挂羊头卖狗肉，用不符合饮用水卫生安全标准的不锈钢、硅胶圈，而且由于发泡技术不过关，聚氨脂保温层不能与水完全隔离，这样的热水器里边的水是坚决不能饮用的，刷锅洗碗都不行。3、如果热水器许多天没有用过，里边的水也不能饮用。
想知道太阳能热水器中的水能否饮用的最简单的方法就是看这个品牌或型号的太阳能热水器有没有通过相关卫生部门的饮用水安全认证。
绝大多数太阳热水器说明书上都注明：不得食用。
理由是：
第一，进入热水器内虽是清洁的自来水，但用来制造热水器管道的金属，往往含有一些超标的有害毒物，如铅、镉、锰、砷等，长期用来煮饭，这些有害物质会影响人的生长发，
对人体健康是极为有害。
第二，进入水箱的自来水，因管网二次污染，水里的氯又会增加产生致癌物质的三卤甲烧。
第三，太阳热水器加热的水温一般在40度至70度之间，适应病菌、病毒的大量繁殖。再加上太阳能里的水往往又是隔夜的，由于长时间滞留和温度的影响，水里起消毒作用的氯会逐渐减少甚至消失，更促进储水箱和管道里水中微生物和细菌的增长。