中国科学技术大学和复旦大学的名校标签几乎是一样的，同为国内第一批985工程大学、C9联盟院校、华东五校、世界一流大学建设高校A类大学、强基计划试点院校。在双一流学科数、学科评估A档学科总数、一级学科硕博点授权数、专职两院院士人数等方面，也都有非常不错的实力体现。在历年的各省的高考志愿填报热度上，中国科学技术大学和复旦大学都是国内TOP8的名牌大学。客观来说， 中科大和复旦，可以看作是一样好的两所大学 。
假如你有冲击中科大的复旦的实力，那么我们还是要从专业的维度上进行更为细致的比较，以自己的兴趣爱好、优势技能和职业理想为出发，选择两所学校相对较好的学科进行填报。
高考志愿填报时，同学们可以参考两所学校各自的优势学科进行选择1、中国科学技术大学
中国科学技术大学目前有 37个本科专业、一级学科授权博士点28个、一级学科授权硕士点34个 。从学科评估的结果上看， 中科大入选的A档的学科一共有15个 ，其优势学科主要集中在理学和工学两个大的门类， 中科大即是一所非常典型的理工院校，理学相对工学也更好一些 。
2、复旦大学
复旦大学目前有 76个本科专业、一级学科授权博士点37个、一级学科授权硕士点43个 。从学科评估的结果上看， 复旦入选的A档的学科一共有23个 ，其优势学科覆盖 人文社科类、理学、 和 医学 ， 复旦的学科数量多且覆盖面广，是综合型大学的代表 。
综合小结客观来说，中国科学技术大学和复旦大学属于同一级别档次的大学，无论是顶尖学科实力、科研力量、优质师资还是学校声誉和品牌影响力，其实差别并不大。但相对而言，复旦大学位于魔都上海这座中国最好的城市，区位优势比中科大所在地合肥要强不少。除此之外，复旦的本科数量也要比中科大更多，人文类学科是其优势，在高考志愿填报的时候，对于文史类的头部考生来说，复旦是一个非常好的选择。虽然中科大的理学很突出，但复旦的理学也并不弱，当然，如果你要学工科的话，那么自然首选中科大的专业会更多也更好一些。上述，即是我给大家的建议。有跟多想了解的内容，不妨在文末留言，或者私信。互相学习，一起进步。
这个怎么说呢！大学之间的比较，本来就是很难的，每个人都有自己的看法，也都有自己的观点，俗话说，适合的才是最好的！这不是比较3和2谁大？那3肯定比2大！大学之间比较，情况错综复杂，一言难尽。科大，就是中国科学技术大学，坐落于合肥，1958年创建，由中国科学院直属。科大的命运比较坎坷，70年代由于特殊原因，疏散到外地，先是河南南阳，再是安徽安庆，费尽波折最后落脚于合肥。这其中的原因很让人心酸！为啥各地都不要呢？因为那时吃不上饭，哪个地区也不愿意多一张嘴吃饭，最终落户合肥也是阴差阳错。
概括的讲，科大小而精！理科独步天下。尤其是物理学，除了清华还能与它扳扳手腕外，其他高校都望尘莫及。中国科学院大学没成立之前，中国科大是中国科学院直属的唯一的一所高校。科大研究理论的，这在国外可是十分吃香的，但在国内呢，多少有点尴尬！因为它不是工科，也不是文科，理论转化成成果需要很长时间。中国人普遍比较浮躁，急功近利，只看眼前利益，再加上中国目前处于高速发展期，各种工程、各种建设如火如荼，因此工科在全国是最吃香的。你拿理论去应聘某单位，大概率不受欢迎。因此，科大的学生大部分、绝大部分都是要考研的，然后出国深造。本科就业率很低！不过，科大的院士率是全国高校中最高的！是中国两院院士的摇篮，千分之一的院士率冠绝全国。也就是说，科大1000个学生中会出一个院士！也许你不经意间迎面碰到一个同学，多年后他（她）可能就是院士。
科大的学风严谨，比较苦，女生少，个个认真苦学，学风踏实，进去之后要能受得了孤独和寂寞。毕业生大部分都是从事科研方面的工作。
复旦大学，这个不用说了，中国著名学府！身处魔都上海，先天条件优越。解放后的学科大调整，复旦占尽便宜，本来它就是一所民办、私办高校，摇身一变，成为中国重点大学。论名气，复旦肯定超过科大，在中国，即便是偏远山区的老人也知道复旦大学！除了北清，就是复旦！科大是一所很低调的大学，而复旦名声在外，与上交齐名，再往前二三十年，复旦秒杀上交！
复旦的文科比较厉害，工科也相对较弱。比较录取分数，复旦略高于科大，不过差别不大，席地之分。在江苏，复旦一般在420分左右，科大在415分左右。科大和复旦，到底哪个好？仁者见仁，智者见智。论名气，当然是复旦，论地理位置，还是复旦。想以后从事科研工作，选科大，想出国留学，选科大，想踏实做学问，选科大。
不过，如果是我选，我选复旦！毕竟是名牌大学。其他方面，二校的地位、级别都一样。至于什么211、985、副部级、中央直管、教育部直属，都一样。科大是中国科学院直属的。科学院不比教育部差，也是国务院管辖的正部级单位，与教育部相同。具体来说，还要看个人兴趣和志向，以后的发展道路。话又说回来，这两所大学，考上哪个都不错呀！我要是能进入，随便哪个都会笑醒的！
国防科大是直属中央一所高等学府，比985、211还更胜一筹，考入这所学府那你是捧金饭碗。 复旦大学就是一个985学府，和国防科大相比还是有很大差别。
中科大的工科学术更好一些,复旦属于综合类
两所学校伯仲之间
除了上海以外，在其他省份招生的话，分数线基本差不多，科大招生的人数要少，科大属于研究性大学，物理生物，这些是他的强项，复旦属于综合性大学，也有文科类，上海第一医学院现在也属于复旦，复旦数学比较强，这两个大学无法直观的对比。
科大和复旦都很好，都是中国的顶尖级大学和领军大学，都是在海内外具有绝对影响力的全国重点大学，也都是985工程大学和双一流建设大学。无论谁家的孩子考上这两所大学中的任何一所大学，绝对都是精英中的精英，绝对都是龙飞凤舞，光宗耀祖前程远大。
中国科学技术大学是中国科学院大学，它是培养从事我国某些领域卓越人才的领军大学，是培养从事学术型人才的全国重点大学，它的物理学，化学和量子力学在世界都有绝对的影响力，量子通信位于世界前沿领域。它是培养具有国际视野，创新思维，创新能力，卓越人才的学术研究型大学。因此，考生如果想成为某一领域的卓越人才和领军人才，并且，对中国科学技术大学的相关专业感兴趣，就可以选择报考中国科学技术大学。
复旦大学是教育部直属的985工程大学和双一流建设大学，它的综合实力位于我国高等院校的前列。而且持续发展，动力澎湃，经久不衰。
复旦大学的专业实力也相当强大。它的保密技术，文物与博物馆学，在我国的高等院校中，排在第一名。
数学与应用数学，智能科学与技术，数据科学与大数据技术，汉语言，新闻学，临床医学，基础医学，药学，护理学， 历史 学， 旅游 管理，广播电视学等专业也绝对强大。
如果从综合实力的角度出发进行比较，复旦大学要比中国科学技术大学强大。
总而言之，中国科学技术大学和复旦大学都非常好，都有自己的独特专业考生，可以根据自己的兴趣，爱好，人生职业生涯发展规划以及潜力和潜能等因素进行综合分析，科学选择。
先说结论：首选复旦。
基础科学本科之后大概有这么几个去向：
（1）转行，包括直接就业和读其他专业的研究生；
（2）出国深造；
（3）国内继续攻读本专业；
（4）退学或者延期毕业。
对应以上四条我们逐个分析题主说到的三个学校：
（1）复旦学科门类更齐全，地处上海，在转行的选择上更为丰富；中科大各方面略逊一筹；国科大彻底把这个选项帮你砍了。
（2）复旦和中科大的海外声誉和出国率都非常高，国科大略逊一筹；
（3）国内读研，复旦和中科大的理科保研率都是溢出的，不要挂科太多或者杀人放火基本都可以躺着保研，国科大则需要和广大二本群众一起考研；
（4）退学或延期毕业，国科大在这一项上遥遥领先。
综合实力肯定复旦好一些，复旦文科名显高于中科大，理科没有比中科大差多少，至于工科，两者都没啥优势，浙大上交工科才是王者，农学嘛，两者也没有，医学嘛，复旦医学秒杀中科大，所以整体比较起来，还是复旦略强。
这两个学校都是国内的知名高校，但是我觉得复旦大学可能会更加好一点。
首先呢，复旦大学是位列国家首批“双一流”（A类）、“985工程”、“211工程”重点建设高校，入选珠峰计划、强基计划、111计划、2011计划等的一个文理综合大学，人文 社会 科学（文学、史学、哲学、新闻、管理等）和理科（数学、物理、化学等）实力非常强；而中科大是一个理工类为主的大学，数学、物理等理科和计算机、电子类等工科专业实力强劲，非985院校也不是211院校。其次，就两所高校所在的地理位置来说，复旦上海属于一线城市，以后的发展和竞争都会更大，对自己经济学校环境要求比较高的话，可以考虑这个学校。
相比较而言，科中大学位于安徽省合肥市，则是处于中部地区，经济发展水平等相比上海有差距偏向理工类，总的来说大概是这样的情况。