2011年蝠鲼已被列入国际公约---保护迁徙野生动物物种公约（CMS），国际自然生态保护联盟（IUCN）已将蝠鲼归类为濒危物种。曼塔信托基金是一个总部位于英国的慈善机构，致力于蝠鲼的研究和保护工作。该组织的网站也提供蝠鲼保护和生物学的信息资源。
2013年《濒危野生动植物种国际贸易公约》（CITES）将双吻前口蝠鲼和阿式前口蝠鲼两种前口蝠鲼作为濒危野生动物列入公约附录二。中国作为缔约国，将从2014年9月14日起对以上两种蝠鲼实施保护，对蝠鲼国际贸易进行监管。 各国蝠鲼保护措施 地 点种 类措施印度尼西亚所有蝠鲼种类建立世界上最大的蝠鲼保护区，面积达596万平方公里，保护区内禁止一切蝠鲼捕捞和制品贸易。澳大利亚双吻前口蝠鲼和阿氏前口蝠鲼禁止在海洋保护区侵扰和捕捞美国夏威夷双吻前口蝠鲼和阿氏前口蝠鲼H.B.366 2009禁止捕捞和贸易美国佛罗里达双吻前口蝠鲼和阿氏前口蝠鲼佛罗里达行政令68B-44.008-禁止捕捞美国关岛双吻前口蝠鲼和阿氏前口蝠鲼2011 44号-31号法案禁止销售/交易蝠鲼器官马尔代夫所有蝠鲼种类1995年禁止出口所有蝠鲼制品日本八重山群岛双吻前口蝠鲼和阿氏前口蝠鲼海洋保护区厄瓜多尔所有蝠鲼2010年厄瓜多尔官方093号文克罗地亚姬蝠鲼2006野生动物分类法律严格保护
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