1、经营领域不同：
商贸有限公司的领域范围：
五金交电、汽车配件、针织品、日用百货、电子产品、建筑材料、工艺美术品、玩具、销售电脑、服装服饰、皮革制品、工艺礼品、包装材料、体育用品、办公用品、家具。
科技商贸有限公司的领域范围：
从事计算机信息科技领域内技术开发、技术咨询，计算机软件开发，计算机网络工程，化工原料及产品，仪器仪表，机械设备，电子产品，Ⅰ类医疗器械销售。
2、从事业务不同：
商贸有限公司的从事业务：
各种进出口商品的品质、卫生、安全质量检验（包括感官的、物理的、机械的、化学的、生物的和微生物检验）各种进出口商品的数量鉴定（包括衡器计重、水尺计重、容量计重），以及整批货物和包装内货物的数量鉴定（包括件数、长度、面积、体积等）。
科技商贸有限公司的从事业务：
电子、计算机、网络专业技术开发，计算机及配件、电子产品、通信设备及配件、文化用品、办公用品、五金交电、仪器仪表、机电产品、百货的销售，从事货物进出口及技术进出口业务。
3、行业类别不同：
商贸有限公司行业类别：
商贸公司属于第三产业中的商业和服务业一类的商贸公司。商贸有限公司的主要业务是商业，店铺，商业的团体，贸易就是物流，商品的周转，总的来说就是以店铺为中心的有关货物销售与周转的有限责任公司。
科技商贸有限公司行业类别：
科技有限公司属于IT技术服务行业，科技创新类的，企业所得税税率为25％。拥有核心自主知识产权，是国家需要重点扶持的高新技术企业。