招标代理机构的优劣决定了招标项目的实施效果和质量，选择一个合格的招标代理机构，对招标项目的完成至关重要。建议招标人尽量采用竞争性的方式（如招标方式）选择招标代理机构。选择招标代理机构时，注重考察招标代理机构的资质文件、完成类似项目的业绩、专业人员的配备、招标代理活动的质量保障以及有无投诉等情况。选定招标代理机构后，应当与其签订书面委托代理协议，明确招标代理机构的代理范围和权限、具体的代理工作流程（便于招标人监管关键步骤的实施）、质疑投诉的处理、违法行为的赔偿、代理服务费支付条款等。
选择招标代理机构主要从以下六个方面：
1、招标人自主选择招标代理公司。《招标投标法》规定，招标人有权自行选择招标代理机构，委托其办理招标事宜。任何单位和个人不得以任何方式为招标人指定招标代理机构。因此，招标方在确定招标代理公司上是完全自主行为，不任何外界力量所干扰。
2、看招标代理机构的资质。虽然目前招标代理资格取消了，但是很多招标代理机构还有具备资质的，这是一个重要的参考因素。
3、看招标代理机构的规模。主要包括企业办公环境、企业基本信息、规模大小等，由此可以大概知晓企业的综合实力。
4、看招标代理机构的人员组成。特别是如果能看到专业技术人员的组成以及从业经验、实操经验就更好。
5、看招标代理机构的历史业绩。指的是招标代理机构代理项目的中标情况、中标金额等情况，可以看出企业在过去一段时间内的整体表现情况，具备重要的参考作用。
6、在确定程序上实现公开、客观。现在招标代理公司成立注册手续简便，进入门槛较低。建议通过遴选入库、随机抽签、定期考核的方式来确认招标代理公司。遴选入库，是指网上发布公告，通过综合评审方式遴选几家实力强的招标代理公司，建立招标代理公司库。随机抽签，是指有建设项目时，组织人员从招标代理公司库中随机抽取一家公司进行项目委托。定期考核，一年或二年对招标代理公司考核一次，将不合格的公司进行淘汰，或补录一些优秀公司。
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