DNA峰图怎么判断结构、移码、结合之类的

Question

如题所述

Answer 1

DNA峰图就是DNA的一级序列，你只能看到序列信息，不能看到二级或三级结构。所以，移码是可以看出来的。比如

图中每一个主峰前面都有一个与之一样的小峰，说明测序样品是一个混合物，有少部分样品在这段序列之前的某一个位置有一处碱基缺失，造成了移码。

如果序列中有复杂DNA结构（例如发卡结构）有时会影响到测序反应，在峰图上的表示就是到某处之后峰图信号变差，可信度降低。例如，

正常测序反应800bp以内的信号都很好，但上图中前面信号很好，到310bp之后就突然变坏，就是DNA中有高级结构。

至于结合，不明白你的意思。但是测序中有一种多位点结合的问题，就是测序引物和模板匹配的特异性不高，致使引物可以在多个位点结合。因为测序本来就是一个PCR反应，如果引物多位点结合，产物就不是单一产物，表现在峰图上就是套峰。例如，

上图中每个位置除了一个主峰之外还有一个不可忽视的小峰，说明引物结合在两个不同的位置，测序的结果有两个，即主峰和套峰。产生这个问题的原因可能是测序引物设计的问题，也可能是模板不纯。