主要区别是，性质不同、生产工艺不同、特点不同，具体如下：
一、性质不同
1、柔印
柔印是一种直接印刷方式，由于使用具有弹性、凸起的图像印版而称为柔版印刷。
2、凹印
凹印指凹版印刷，先将印刷版上多余的油墨刮净，然后通过压印胶辊给印刷版之间的被印刷物上，加以适当的压力，把油墨从凹面内挤压到被印刷物上的一种印刷方式。
二、生产工艺不同
1、柔印
从原稿设计和制版工艺角度来看，柔版印刷工艺自成体系、有其自身的独特之处，其制版工艺流程基本如下：
原稿→电子分色或照相→正阴图→背曝光→主曝光→显影冲洗→干燥→后处理→后曝光→贴版。
2、凹印
凹版印刷由于印刷机的自动化程度高，制版质量好，因而工艺操作比平版印刷简单，容易掌握，工艺流程如下：
印前准备→上版→调整规矩→正式印刷→印后处理。
三、特点不同
1、柔印
①、设备结构比较简单因此操作起来也比较简单、方便。
②、柔性版印刷采用的是卷筒材料，不仅能够实现承印材料的双面印刷，同时还能够完成联线上光（或者覆膜）、烫金、模切、排废、收卷等工作。大大缩短了生产周期，节省了人力、物力和财力，降低了生产成本。
③、承印材料范围比较广泛,例如纸张、塑料薄膜、铝箔、不干胶纸等等。
④、印刷品质量好，印刷精度可达到150线/英寸，并且印刷品层次丰富、色彩鲜明，视觉效果好，特别适合包装印刷的要求。
2、凹印
①、凹印版的承墨部分是下凹的，因而可以承接较大量的油墨，如与凹印机上的静电吸墨装置配合使用，则更可获得殷实的墨层、鲜艳的色彩及丰富的层次。
②、相对成本低由于凹印版的整个版面由一层坚硬的金属铬层保护，所以即使在印刷时有刮刀与版面不停的接触，仍然保持了较高的耐印力，一般可达几百万印。
③、胶印是将制好的印版包在印版滚筒上的，因此，在版辊表面始终存在一条区域用于固定印版。凹印版则不同，由于凹印版的制版操作是直接在滚筒筒体上进行的，所以不要滚筒上的图像做到无缝拼接，就能在承印物上得到连续绵延的图案。
④、凹版印刷既可在传统的纸张上进行印刷，又可在薄膜、铝箔、转印纸等其他材料上印刷。
参考资料来源：百度百科-柔印
参考资料来源：百度百科-柔版印刷
参考资料来源：百度百科-凹印
参考资料来源：百度百科-凹版印刷
凹印的扩张小，网点可出现缩小现像，反正区别很大的，你可以到各个印刷网去看看。如cpc本回答被提问者采纳
柔印是柔版，可以使用UV油墨，比较环保。设备贵一些，高速柔印机在200万以上。辅助设备类似。总之凹印设备便宜、印刷速度快、但版费贵，不环保。柔印设备贵，速度比较快。版费中等。