他们当然不是同一个民族。所谓的古羌族是一个古代民族即在历史上存在过的而现在已经不存在了的民族。
古羌族是他们的祖先，就像炎帝，蚩尤和黄帝三个部落是汉族的祖先一样。
分开这几个民族是有根据的：
1 来源不同：彝族是古羌人南下在长期发展过程中与西南土著部落不断融合而形成的民族（六七千年前）。 白族是在新石器时代（约4000年前）定居苍山洱海和滇池为中心的地区。 纳西族则有可能是云南当地的土著（还没有最终确定，但考古有所发现）
2 语言不同：彝族，拉祜族，纳西族语言汉藏语系藏缅语族彝族支 ，白语属汉藏语系藏缅语族，但各民族之间语言不通。
3 地域不同：彝族主要分布在云南、四川、贵州三省和广西壮族自治区的西北部。白族主要分布在云南省大理白族自治州，丽江、碧江、保山、南华、元江、昆明、安宁等地。拉祜族主要分布在云南省澜沧江流域的思茅、临沧两地区。纳西族主要聚于云南省丽江市古城区、玉龙纳西族自治县、维西、香格里拉（中甸)、宁蒗县、永胜县及四川省盐源县、木里县和西藏自治区芒康县盐井镇等 。
4 宗教不同：纳西族信仰东巴教，白族有本主崇拜，彝族，拉祜族也各自有其宗教。
按照马克思有关民族的定义，他们显然不是一个民族。
至于你的第二个问题，也是不可能的，满族，苗族，土家族人口都超过500万，不也没有建立自治区吗？
他们是新中国政府按照马克思关于民族的定义而分开的，但其实他们在实际上已经自然的分开了。
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