医保和新农合是两个不同的医疗保险制度。医保主要针对城市居民及企业职工（居民医保和职工医保），职工医保的比率一般要比居民医保要高。新农合主要是针对农村人口实行的医疗制度。新农合一般上缴的费用比职工医保要低很多。一般地方的比率是职工医保大于新农合大于等于居民医保。具体的报销比率都是当地相关部门制定，跟当地的经济发展密切相关。
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新农合的产生
新型农村合作医疗，简称"新农合"，是指由政府组织、引导、支持，农民自愿参加，个人、集体和政府多方筹资，以大病统筹为主的农民医疗互助共济制度。采取个人缴费、集体扶持和政府资助的方式筹集资金。
2002年10月，中国明确提出各级政府要积极引导农民建立以大病统筹为主的新型农村合作医疗制度。2009年，中国作出深化医药卫生体制改革的重要战略部署，确立新农合作为农村基本医疗保障制度的地位。2015年1月29日，国家卫计委、财政部印发关于做好2015年新型农村合作医疗工作的通知提出，各级财政对新农合的人均补助标准在2014年的基础上提高60元，达到380元。
城镇居民医疗保险与新农合的区别：
一、是覆盖的人群不同。城镇居民医保主要覆盖城镇户籍的居民，新农合主要覆盖农村户籍居民。农村新型合作医疗是国家针对农民实施的一项医疗保障制度，它的基本设计是每位参保农民个人每年交费220元，国家财政每人每年配套补助增长，今年应该会在500元以上，各省市将出台文件予以说明。构成医疗保险基金，主要用于农民生病住院的费用补助，报销比例为60-75%，最多可报金额参照当地出台文件。
农村新型合作医疗以户为单位自愿参保，不能强迫参保，在一户中不能某些人参保而其他人不参保。城镇职工个人基本医疗保险是针对城镇职工(包括农民工)实施的一项基本保险制度。它的缴费由个人和单位两部分构成，缴费标准为单位和个人各缴纳月工资的2%，共4%。保险费中一部分根据职工年龄及缴费年限等条件按一定比例划入职工个人医疗帐户，发给职工个人医保卡。
二、是管理的部门不同。城镇居民医保主要由人社部门管理，新农合多数地方由卫生部门管理。
三、是保障待遇的侧重点不同。城镇居民医保主要保住院和门诊大病兼顾普通门诊，所以住院及门诊大病待遇都要高于新农合。新农合的门诊待遇水平要高于城镇居民医保。
1、新农村合作医疗是农村户口的买，居民医疗保险是非农业户口的买。
2、新农合主要是让农民在乡镇卫生院报销多，起付线低，在城里的医院报得相对少些；居民医疗保险起付线比新农合稍高，在大医院报销比例稍高一点，交钱也交得多一些。
3、新农合可报销的医药目录比城镇医保少，新农合在乡镇医院报销比例高，在市级医院平均报销比例比城镇医保低百分之一二十，最高封顶也比城镇医保少。本回答被提问者采纳
新农合和社保有冲突吗？
新农合和社保不能并存，是可以相互转化的。新农合只跟城镇居民医保、职工医保有冲突，国家规定不得重复参加，跟商业保险没有冲突，前三者都是国家的惠民政策，商业保险是以盈利为目的，国家没有相应的扶持资金，所以对公民来说可随便参加。
新农合与社保的区别在哪里？
新农合:一是只能农民才可以参加;二是必须以家庭为单位整户参加;三是新农合是一年一交费，一年一参合，参合本年度享受报销;四是因新农合基金筹措有限，保障力度略低;五是新农合为国家的政策，以解决参合农民“因病致贫、因病返贫”为最终目的。
社保中的医保就不一样啦，具有"低水平，广覆盖"的特点，缴费以低水平的绝大多数单位和个人能承受的费用为准，广泛覆盖城镇所有单位和职工，不同性质单位的职工都能享有基本医疗保险的权利。参保人员完成缴费年限后可以终身享受。其次基本医疗保险具有"双方负担，统账结合"的特点;以"以收定支，收支平衡"为原则。按统一标准享受待遇。
总的来说两者之间的区别可以说是新合作医疗费用便宜，与医保相比更具普及意义，更体现全民医疗;合作医疗的报销比值浮动很大，最后报下来肯定不如医保的报销高。
农村医保和社保的区别在缴纳费用、包含项目和缴费方式。 缴纳费用不同：相比之下农村医保的费用低很多； 包含项目不同：社保除了包含医保还包括养老、失业、工伤和生育保险；农村医保是由参保人负担全部费用，而社保是由职工和公司一起承担费用的。