清华大学、北京大学、北京理工大学、哈工大、西安交大、南大、复旦、上交、浙大、中科大
原本是8所，后来说国防系统的也要扶持，就加上了哈工大和北理工。
985工程重点共建协议对各大学的定位及合同拨款额
根据国家教委和各省、市及部委所签订的合同，依据合同书对各学校的定位及资金资助情况（三年内拨款经费总量），按照签约时间，分列如下：
一、“世界一流大学”
北京大学 18亿 （教育部拨款）
清华大学 18亿 （教育部拨款）
二、“国内一流、国际知名高水平大学”
浙江大学 14亿 （7亿+7亿） （教育部拨款+省拨款） 1999年11月8日
南京大学 12亿 （6亿+6亿） （教育部拨款+省拨款） 1999年7月26日
复旦大学 12亿 （6亿+6亿） （教育部拨款+市拨款） 1999年7月27日
上海交通大学 12亿 （6亿+6亿） （教育部拨款+市拨款） 1999年7月27日
中国科技大学 9亿 （3亿+3亿+3亿）（教育部拨款+中科院拨款+省拨款）1999年7月25日
西安交通大学 9亿 （6亿+3亿） （教育部拨款+省拨款） 1999年9月11日
哈尔滨工业大学 10亿 （3亿+3亿+4亿）（教育部拨款+国防科工委拨款+省拨款） 1999年11月14日
北京理工大学 10亿 （3亿+3亿+4亿） （教育部拨款+国防科工委拨款+市拨款） 2000月9月23日
北京师范大学 12亿 （6亿+6亿） （教育部拨款+市拨款） 2002月8月24日
中国人民大学“国际知名的世界一流大学”（未签约、经费未公布）
参考资料：http://www.yanlutong.com/xuexiao/article2146.asp