海关进口增值税专用缴款书在抵扣时在申报表表二中的第五栏次中金额应该填写什么？是填写完税价格吗？税额填写税款金额吗？还是只填写税额栏，金额栏不用填写呢？
海关进口增值税专用缴款书在国税申报系统里抵扣流程：
1）.下载国税通用税务数据采集软件，进入后填写海关完税凭证抵扣清单，数据提交申报后再导出CRC.XML文档和JK.XML文档；
2）.再进国税网/海关凭证抵扣导入；导入后申报表表二会自动生成；注意专用缴款书和增值税抵扣联一样，都要在当月底最后一天内认证，超过当月了就属于下月的抵扣进项了；计入增值税进项税额：
进口增值税记入增值税进项税额，进品关系记入原材料等存货科目；
借：原材料（或存货科目）（进口关税）
应交税费-应交增值税-进项税额（进口增值税）
贷：银行存款（或库存现金）
取得海关报关单，根据报关单货物内容，可记入原材料等存货科目；
借：原材料（或存货科目）（海关报关单）
贷：银行存款（或库存现金）