从你比较的两个专业来说，应该是两个高级技术或高职设置的专业，从两个课程的设置来看，应该是比较相近的专业，区别意义不大。下面我是看了两个学校的不同课程设置：从课程设置来看，机电一体化偏电类，另一个偏机械的安装。但两个有互有交叉。因为现代工业上机电不分家。
机械设备装配与自动控制
培养目标：培养从事机械、电气设备和生产线的制造、装配调试、运行操作、维护管理的中级技能人才（中级工）。
学习年限：3年（初中毕业）
职业能力：具有积极的人生态度、健康的心理素质、良好的职业道德和较扎实的文化基础知识；具有获取新知识、新技能的意识和能力，能适应不断变化的职业社会；了解企业生产流程，严格执行机械设备操作规定，遵守各项工艺规程，具有安全生产意识，重视环境保护；具备识读机械零件图与简单装配图，熟悉零件的加工工艺，并能选择合适的机械制造加工方法；能读懂高、低压电器相关设备的装配图、电气控制原理图及接线图；能分析、检修、排除机械设备的电气部分常见故障；能操作、安装、调试及维护常用机械加工设备；能分析设备的机械传动、控制电路；能进行生产自动控制的基本操作及简单故障排除；并能解决一般性专业问题。
专业名称：机电一体化技术
专业代码：580201
专业培养目标：培养从事机电一体化设备的使用和技术管理工作的高级技术应用性专门人才。
专业核心能力：机电一体化设备的安装、调试、操作、维修和管理。
专业核心课程与主要实践环节：电工与电子技术、机械制造技术、液压与气动技术、机电设备控制技术、数控加工工艺与编程、微机原理及应用、可编程控制器、测试技术、数控机床故障诊断与维护、CAD实训、数控机床的编程和操作实训、机床电器控制实训、数控加工实训、液压与气动实训、金工实习、电工电子实习、毕业实习（设计）等，以及各校的主要特色课程和实践环节。
可设置的专业方向：机械电子技术、机械制造与计算机控制、机器人应用、机电设备及自动化、数控机床使用和维修、数控设备管理和维护。
就业面向：机械制造工艺设计与实施、工装设计与实施、机电一体化设备的管理和维护、数控机床的编程和操作等工作。
追问那个比较好一点 、工资 等多方面
追答两个都是技术工人，工资方面应该从你找的工单位有差别，即使同一个职业，不同单位差别较大。有时取决你的工作能力。
就专业来讲，以前感觉自动化方面比较好，但近些年，由于机械方面同于我国的迅速发展，装备业的落后，机械行业的就业状况和待遇也在不断提升。
其实我最初跟你讲了，机电不分家，两个区别不太大。以后就业方面也许有交差的地方。特别是一些企业分工并不太细。比如我原先是机械方面，现在搞起了自动化。
在选择职业上，你可以根据你的兴趣，喜欢机械还是电。这样会对你的职业培养有帮助。