由于分公司是非独立核算的，看对方是否以其总公司（在中国境内的一般纳税人）名义来开， 对于非一般纳税人，只能开增值税普通发票。
1、分公司是由总公司依法设立的，分公司的主要业务活动完全由总公司决定，分公司一般是以总公司的名义并根据它的委托来进行业务活动的。
2、分公司没有自己独立的财产，分公司的所有资产全部属于总公司。分公司与总公司在经济是统一核算，其实际占有和使用的财产是总公司财产的一部分，列入总公司的资产负债表中。
3、分公司不是公司，它的设立不须依照公司设立程序，只要在履行简单地登记和营业手续后即可成立。
4、分公司不独立承担民事责任，没有董事会等形式的公司经营决策和业务执行机关，总公司要对分公司的债务负无限责任。
5、分公司没有自己独立的名称和章程，而只能使用与总公司同样的名称和章程。
扩展资料：
注意事项
总公司管理分公司,对所属分公司在生产经营、资金调度、人事管理等方面行使指挥、管理、监督的权利，具有法人资格，可以独立承担民事责任。
分公司是与总公司相对应的法律概念，是指在业务、资金、人事等方面受总公司管理，不具有法人资格的分支机构。分公司在法律、经济上没有独立性，属于总公司的附属机构。
（1）分公司没有自己的独立财产，其实际占有、使用的财产是总公司财产的一部分，列入总公司的资产负债表。
（2）分公司不具有法人资格，不独立承担民事责任。
（3）分公司的设立程序与一般意义上的公司设立程序不同，设立分公司只需办理简单的登记和开业手续。
（4）分公司没有自己的公司章程，没有董事会等公司经营决策机构。
（5）分公司名称为总公司名称后加分公司字样，其名称中虽有公司字样，但不是真正意义上的公司。
参考资料来源：百度百科-分公司
可以开发票。但必须取得营业执照以及国、地税务登记证。分公司在进行了税务登记后，可以向税务局申领发票。如果分公司业务开具的是增值税发票，分为以下三种情况：
1、你公司设立的分公司如果是一般纳税人，你们就可以互相开具增值税专业发票。
2、如果分公司是小规模纳税人，他只能给你开具普通发票，而且总公司不能抵扣；你也只能给他开具普通发票，在他那里不存在着抵扣问题。
3、但是小规模纳税人可以向税务部门提出申请，委托代开增值税税率为3%（自09年起不再区分工、商业，一律按照3%征收）的专用发票，但是对方公司只能3％的进项税额，从自己的销项税额中抵扣。
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种类：普通发票和增值税专用发票。
普通发票：主要由营业税纳税人和增值税小规模纳税人使用，增值税一般纳税人在不能开具专用发票的情况下也可使用普通发票。普通发票由行业发票和专用发票组成。
前者适用于某个行业和经营业务，如商业零售统一发票、商业批发统一发票、工业企业产品销售统一发票等；后者仅适用于某一经营项目，如广告费用结算发票，商品房销售发票等。
增值税专用发票是我国实施新税制的产物，是国家税务部门根据增值税征收管理需要而设定的，专用于纳税人销售或者提供增值税应税项目的一种发票。
专用发票既具有普通发票所具有的内涵。同时还具有比普通发票更特殊的作用。它不仅是记载商品销售额和增值税税额的财务收支凭证。而且是兼记销货方纳税义务和购货方进项税额的合法证明，是购货方据以抵扣税款的法定凭证，对增值税的计算起着关键性作用。
参考资料来源：百度百科-发票
2、增值税专用发票是有一个抵扣期限的（180天），如果在抵扣期限内，你的增值税专用发票没有被抵扣，税局可能会来找你麻烦。
非经营性质的，只是总公司的一个研发机构。
追答非经营性质的分公司就不能申请发票了，要不做经营范围的变更，要不只能从总公司开具发票。
追问那我分公司采购进来的东西销售的话只能是总公司开票销售吗？
追答你要是分公司是非经营性质的，你采购再销售属于超范围经营了。方便的话您把分公司的经营范围发出来。您要是做销售的话，我建议做分公司经营范围的增项。不过公司法有规定，分公司的经营范围不能超过总公司的经营范围。
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