一、性质不同
1、辅酶：一大类有机辅助因子的总称，对于酶的氧化还原、基团转移和异构反应的必须因子。
2、酶：由活细胞产生的、对其底物具有高度特异性和高度催化效能的蛋白质或RNA。
二、作用不同
1、辅酶作用：
（1）抗心肌缺血作用。
（2）增加心输出量和降低外周阻力有助于抗心力衰竭效果。醛固酮的合成和分泌可抑制和干扰其对肾小管的作用。
（3）抗心律失常作用。
（4）降低外周血管阻力。
（5）能激活人体细胞营养和细胞能量，提高人体免疫力，增强抗氧化能力，延缓衰老，增强人体活力。此外，还有抗阿霉素的心脏毒性和肝脏保护作用。
2、酶作用：
（1）催化作用
酶是一类生物催化剂，在代谢、营养和能量转化等许多催化过程中起主导作用。大多数与生命过程密切相关的反应都是酶促反应。
（2）催化机理
酶的催化机理与一般化学催化剂基本相同。它还与反应物（酶底物）结合形成复合物。降低反应能可以提高反应速度。在恒温条件下，化学反应体系中各反应物分子的能量相差很大，但平均值较低。这是反应的初始状态。
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扩展资料：
按照酶的化学组成可将酶分为单纯酶和结合酶两类。单纯酶分子中，只有氨基酸残基构成一个肽链。除了由多肽链组成的蛋白质外，结合酶还含有非蛋白质成分，如金属离子、铁卟啉或含有B族维生素的小分子有机化合物。
结合酶的蛋白质部分称为脱辅酶，非蛋白质部分称为辅因子。它们一起形成全酶。只有整个酶具有催化活性，如果它们被分离，酶的活性就会消失。
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