法律分析：有限公司应该属于一般纳税人，应该建立健全账目核算。一般纳税人和小规模纳税人是国税对生产经营企业纳税管理的不同分类。前者必须建立健全账目，经严格审核后认定，适用查账征收；后者账目不健全，适用核定征收。你公司是有限责任公司，应当建立健全账目核算，主要税收（营业税）是地税，应是查账征收的纳税人。
法律依据：《中华人民共和国税收征收管理法》 第十五条 企业，企业在外地设立的分支机构和从事生产、经营的场所，个体工商户和从事生产、经营的事业单位（以下统称从事生产、经营的纳税人）自领取营业执照之日起三十日内，持有关证件，向税务机关申报办理税务登记。税务机关应当于收到申报的当日办理登记并发给税务登记证件。工商行政管理机关应当将办理登记注册、核发营业执照的情况，定期向税务机关通报。本条第一款规定以外的纳税人办理税务登记和扣缴义务人办理扣缴税款登记的范围和办法，由国务院规定。