在1775年3月，为镇压北美的十三州殖民地革命，英皇乔治三世派兵前往当地，并分别以克林顿、威廉·何奥少将及约翰·伯戈因（John Burgoyne）领军，以加强英军在波士顿的守备。在克林顿等援兵抵达波士顿以前，当地英军自4月一直遭到围困，在同年6月17日，克林顿参与由何奥等指挥的邦克山战役（Battle of Bunker Hill），虽然成功将革命军驱离波士顿港以北的高地，但英军却在战事中损失1,000兵马，付出沉重代价。此后，为免在重蹈覆辙，克林顿曾向何奥强烈要求在波士顿港以南的多尔切斯特高地（Dorchester Heights）驻兵布防，以防被乱军占领，但建议未获何奥采纳。到1776年1月，克林顿获派率兵1,500人向南探索，以考察南、北卡罗莱纳地区的军事机会。克林顿出发后不久，多尔切斯特高地果真在同年3月被革命军占据，革命军更在该地筑垒建寨，最终迫使英军弃守当地，并撤退到新斯科舍的哈利法克斯。
在1776年6月，克林顿所率部队尝试进攻南卡罗来纳查尔斯顿的沙利文堡（Fort Sullivan），但以大败告终，事后他更被召回英方大本营。这次的进击虽然是与皇家海军合作，但克林顿严重低估查尔斯顿的革命军数目，以致战事大失预算。另一方面，海军指挥彼得·帕克爵士（Sir Peter Parker）亦低估了沙利文堡的防御程度，使海军方面对沙利文岛上莫尔特里堡（Fort Moultrie）的进攻被迫中途腰斩，英方分遣舰队损失惨重。这次参与进攻的将士还包括了查尔斯·康沃利斯等人。
克林顿与其麾下25艘船舰在1776年8月重归大队，并与何奥的主力进攻纽约市。克林顿曾建议英军由哈德逊河入侵，但何奥将军未有接纳。此后，英军驻扎于长岛上的格雷夫森德，并采纳了克林顿提出的新方案，使英军在随后的长岛战役中取得重要胜利，他事后因功获擢升为中将。在12月，他又奉何奥之命率兵6,000前往罗德岛，并轻易取下纽波特。在1777年4月，克林顿复获英廷颁授KB勋衔，以示嘉奖他在攻占纽约时所作的贡献。
