区内条件对动植物的生存发展极为有利。植被具有古北植物区系、中亚区系、喜马拉雅区系和印度马来亚区系多种成份。多古植物的孑遗种属，如乔杉、铁杉、连香树、水青树、珙桐等，特别是第三纪的古老植物种类如云杉属和冷杉属种类占中国一半以上。森林资源富饶而广布，是中国第二大林区——西南林区的主体部分。森林种类极为复杂。经济林木和果木丰富。盛产贝母、冬虫夏草、天麻、大黄、三七、麻黄等各种中药材。花卉种类更为繁多，尤以多种杜鹃花、报春花和山茶花为著。
“横断山域文化旅游经济圈”区域面积虽然仅占中国陆地国土总面积的13．92%。但却是中国乃至全世界生物多样性最丰富、最集中的地区之一，素有“植物王国”、“动物王国”之美誉。由于区域内最底点与最高点海拔高差达7700余米，致使这里云集了相当于北半球南亚热带、中亚热带、北亚热带、暖温带、温带、寒温带和寒带等多种气候类型和生物群落，有10个植被型、23个植被亚型、90余个群系。
动物兼具东洋界西南区、古北界青藏高原区和北方华北区等多种成分，兽类、鸟类和鱼类约占中国总数一半以上；珍贵稀有动物属国家保护的有大熊猫、金丝猴、黑金丝猴、白唇鹿、牛羚、野牛、野象、长臂猿、小熊猫、班羚、林麝、豹、云豹、马麝、水鹿、藏雪鸡、绿尾红雉、血雉等。
“横断山域文化旅游经济圈”区域内拥有高等植物460余科、2800余属、18000余种科、属、种的数量分别占中国的95%、73%、65%。其中，有列为国家重点保护的野生植物160种（类），占中国总数的63%。区域内有脊椎动物1900余种，占中国总数的63%，其中陆生脊椎动物1500余种。在中国公布的335种重点保护野生动物中，“横断山域文化旅游经济圈”内就有220余种，占中国总数的66%。“横断山域文化旅游经济圈”内还拥有2200多种观赏植物，其中花卉植物在1700种以上，不少是珍奇种类和特产植物，堪称为珍树、奇花、异草的“花卉王国”。
