明朝不计南明在内，从开国皇帝明太祖朱元璋到末代皇帝明思宗朱由检，共有十六位皇帝。从明朝皇帝世系上看，朱由检是朱元璋的第十一代子嗣。明朝实行“有嫡立嫡，无嫡立长，父死子继，兄终弟及”的皇位继承制度，在明朝这十六位皇帝中，就存在几位非嫡出和互为兄弟的皇帝，但皇位始终都在直系亲属中世袭，血缘关系还是存在的，倒不至于出现中山靖王之后刘备与刘邦那般尴尬的关系。
正德皇帝的老爸是弘治皇帝朱祐樘，历史上出了名的“专情皇帝”，一生只娶了一位女子为妻，就是张皇后。因此他传下来的子女也不多，除了正德皇帝朱厚照，还有一位早夭的次子，这样继承者就只能从弘治皇帝的兄弟那里去找了。最后选了兴献王朱祐杬的儿子朱厚熜，把他从湖北接到京城来“就职”，改年号为嘉靖。
明朝皇位的传承一直是有章可循的，当初开国皇帝朱元璋就定好了的规矩：有嫡立嫡，无嫡立长，父死子继，兄终弟及。整个明朝的皇位传承基本都是按朱元璋这个传承制度来的，所以明朝的皇帝肯定都是一家子，一脉相传。
朱由榔是明丧失大一统地位后，割据南方的南明政权的最后一位皇帝。
朱由榔是桂端王朱常瀛的第四子，明神宗朱翊钧是他的祖父，明穆宗朱载垕是他的曾祖，明世宗朱厚熜是他的高祖，兴献王朱祐杬是他的天祖，明宪宗朱见深是他的烈祖，明英宗朱祁镇是他的太祖，明宣宗朱瞻基是他的远祖，明仁宗朱高炽是他的鼻祖，明成祖朱棣是他的十世祖，明太祖朱元璋是他的十一世祖。
其实朱由检、朱由榔这两位亡国之君虽都是朱元璋的嫡系后裔，但关系、血缘却已是很疏远了，实际上已经超出了我们所认知的“祖宗十八代”的范围，或是早已出了“五服”。
纵观明朝的皇帝世系，我们会发现其实明朝的皇帝传承先后出现4个大宗，也就是从朱元璋开始分出4个分支。第一个分支是朱标一脉，传至明惠宗朱允炆一代，后被朱棣兵变所夺。
明朝虽然不是一脉相传的，但是传位一点不混乱。其中有祖死孙继(朱元璋→朱允炆)、杀侄夺位(朱允炆→朱棣)、兄掳弟继(朱祁镇→朱祁钰)、兄终弟及(朱厚照→朱厚熜、朱由校→朱由检)，其余的多是父死子继。
下面我们一一讲述明朝历代皇帝的血缘关系。
1.明太祖朱元璋→明惠帝朱允炆
朱允炆是明太祖朱元璋之孙、懿文太子朱标次子，1392年朱标视察陕西回来后，因风寒病逝，朱允炆被立为皇太孙，1398年继位为帝，朱允炆继位后开始进行削藩，燕王朱棣打着"清君侧"旗号发动"靖难之役"，1402年朱棣攻入南京，朱允炆下落不明。明朝长子朱标系的传位方式断绝。
2.明惠帝朱允炆→明成祖朱棣
朱棣是朱元璋最能干的儿子，但却是最不孝的儿子，他发动战争杀了朱元璋钦定的继承人朱允炆。此种继位方式是"杀侄夺位"，在历史上是比较罕见的。
从朱棣开始明朝皇帝的世系就归属朱元璋四字系了，朱元璋为燕王一系取的字辈为"高瞻祁见祐，厚载翊常由，慈和怡伯仲，简靖迪先猷。"名字以金、木、水、火、土循环。
3.明成祖朱棣→明仁宗朱高炽→明宣宗朱瞻基→明英宗朱祁镇
这一时期的皇位传递比较明确，朱棣传位长子朱高炽，朱高炽在位一年病逝传位给长子朱瞻基，甚至朱高炽得立为太子都是因为有个好儿子朱瞻基的原因，朱瞻基从小被祖父朱棣宠爱。
朱高炽和朱瞻基父子虽然仅仅统治明朝11年，却被史学家们称之为"功绩堪比文景"，史称"仁宣之治"。朱瞻基传位长子朱祁镇，朱祁镇继位时年仅九岁，开始时国事由太皇太后张氏把持，贤臣"三杨"主政。后来张太后病逝，"三杨"去位，太监王振掌权。
正统十四年(1449年)，明英宗和太监王振亲征瓦剌，在土木堡被俘，其弟郕王朱祁钰登基称帝，遥尊英宗为太上皇。后来被放回，但被弟弟关在南宫长达8年。
4.明英宗朱祁镇→明代宗朱祁钰
朱祁钰当上皇帝算是个偶然，但是朱祁镇亲征让其监国，谁知朱祁镇居然被俘了，当时太子朱见深年幼，朱祁钰临危受命登基为帝，后来打赢了北京保卫战，迎回了哥哥朱祁镇。
但是朱祁钰害怕丢失皇位，禁闭朱祁镇，废掉朱见深太子之位，后来朱祁镇趁朱祁钰病重，在徐有贞和石亨的帮助下发动"夺门之变"，再次登基为帝，并废朱祁钰和杀害于谦。
5.明英宗朱祁镇→明宪宗朱见深→明孝宗朱佑樘→明武宗朱厚照
"夺门之变"后，明朝皇帝重回朱祁镇系，二次登基后仍立朱见深为太子。天顺八年，朱祁镇病逝后朱见深继位，朱见深是一位有恋母情结的皇帝，他最爱年长自己17岁的万贵妃，还差点因为万贵妃而绝嗣，后来万贵妃年老生不出孩子之后，朱见深的妃子为其生下多个皇子，后来万贵妃病死，朱见深对其情深没多久亦死去。
明朝皇帝血缘关系一点都不混乱，从二世祖朱棣开始，一直都是朱棣一脉直系传承，比起宋朝简单得多。
1，明太祖朱元璋登基后，立长子朱标为太子，但朱标命不好，死得早，朱棣对朱标感情很深，又特别喜欢朱标的儿子、大孙子朱允炆，于是便立朱允炆为太子。在还有很多儿子的情况下，立孙子为太子不是明智之举，也为后来的靖难之役埋下了祸根。
2，燕王朱棣是朱元璋的第四个儿子，各方面跟朱元璋很相似，既有野心也有实力，朱允炆继位后开始削藩，朱棣趁机打出“清君侧”的旗号，发动“靖难之役”，经过艰苦卓绝的战争，终于推翻侄子朱允炆，自己登基为帝。
3，朱棣继位后，一度在长子朱高炽和次子朱高煦之间摇摆，后来立朱高炽为太子，朱高炽顺利继位，但朱高炽也不长寿，做了不到一年年皇帝就驾崩了，由长子朱瞻基继位。
1.明太祖朱元璋→明惠帝朱允炆朱允炆是明太祖朱元璋之孙、懿文太子朱标次子，1392年朱标视察陕西回来后，因风寒病逝，朱允炆被立为皇太孙，1398年继位为帝，朱允炆继位后开始进行削藩，燕王朱棣打着“清君侧”旗号发动“靖难之役”，1402年朱棣攻入南京，朱允炆下落不明。明朝长子朱标系的传位方式断绝。
2.明惠帝朱允炆→明成祖朱棣
朱棣是朱元璋最能干的儿子，但却是最不孝的儿子，他发动战争杀了朱元璋亲定的继承人朱允炆。此种继位方式是“杀侄夺位”，在历史上是比较罕见的。
从朱棣开始明朝皇帝的世系就归属朱元璋四字系了，朱元璋为燕王一系取的字辈为“高瞻祁见祐，厚载翊常由，慈和怡伯仲，简靖迪先猷。”名字以金、木、水、火、土循环。
3.明成祖朱棣→明仁宗朱高炽→明宣宗朱瞻基→明英宗朱祁镇
这一时期的皇位传递比较明确，朱棣传位长子朱高炽，朱高炽在位一年病逝传位给长子朱瞻基，甚至朱高炽得立为太子都是因为有个好儿子朱瞻基的原因，朱瞻基从小被祖父朱棣宠爱。
朱高炽和朱瞻基父子虽然仅仅统治明朝11年，却被史学家们称之为“功绩堪比文景”，史称“仁宣之治”。朱瞻基传位长子朱祁镇，朱祁镇继位时年仅九岁，开始时国事由太皇太后张氏把持，贤臣“三杨”主政。后来张太后病逝，“三杨”去位，太监王振掌权。
正统十四年（1449年），明英宗和太监王振亲征瓦剌，在土木堡被俘，其弟郕王朱祁钰登基称帝，遥尊英宗为太上皇。后来被放回，但被弟弟关在南宫长达8年。
4.明英宗朱祁镇→明代宗朱祁钰
朱祁钰当上皇帝算是个偶然，但是朱祁镇亲征让其监国，谁知朱祁镇居然被俘了，当时太子朱见深年幼，朱祁钰临危受命登基为帝，后来打赢了北京保卫战，迎回了哥哥朱祁镇。但是朱祁钰害怕丢失皇位，禁闭朱祁镇，废掉朱见深太子之位，后来朱祁镇趁朱祁钰病重，在徐有贞和石亨的帮助下发动“夺门之变”，再次登基为帝，并废朱祁钰和杀害于谦。
5.明英宗朱祁镇→明宪宗朱见深→明孝宗朱佑樘→明武宗朱厚照
“夺门之变”后，明朝皇帝重回朱祁镇系，二次登基后仍立朱见深为太子。天顺八年，朱祁镇病逝后朱见深继位，朱见深是一位有恋母情节的皇帝，他最爱年长自己17岁的万贵妃，还差点因为万贵妃而绝嗣，后来万贵妃年老生不出孩子之后，朱见深的妃子为其生下多个皇子，后来万贵妃病死，朱见深对其情深没多久亦死去。明孝宗朱佑樘是明宪宗朱见深的第三子，从小为了防止万贵妃下毒手，六岁才敢与父亲朱见深相认，母亲和保护他的太监都相继被害。后来万贵妃因年长生不出孩子，就放肆的让朱见深生孩子，朱佑樘后来继位为帝，他扭转了父亲给他留下的朝政紊乱，国力凋敝的江山，使得明朝得到中兴，史称“弘治中兴”。
朱佑樘是个好皇帝，却不是个好父亲，因为自己从小缺乏父爱和母爱，所以他一辈子就只爱一个女人，而且特别溺爱皇太子朱厚照。以至于朱厚照继位后胡作非为，算得上是荒淫无道的昏君，但是他能弹指之间诛刘瑾，平安化王之乱、宁王之乱，大败蒙古小王子，且多次赈灾免赋。朱厚照在皇位上躁动16年驾崩于豹房，死后无子，所以明朝皇帝又再一次转系了。
明朝皇帝帝位继承过程中经历过“靖难之役”、“土木堡之变”等事件，所以明朝历代皇帝的血缘关系比起清朝皇帝的血缘关系确实要复杂一些。今天就来说点关于明朝历代皇帝血缘关系的情况。
明太祖朱元璋原先立长子朱标为太子，按理说朱标将来是要继承皇位的，但是朱标英年早逝，比朱元璋先离世。
太子朱标去世后，朱元璋立朱标之子朱允炆为皇太孙，作为皇位继承人。朱元璋去世后朱允炆登基为帝，成为明代第二位皇帝，即建文帝。
朱允炆登基后由于削藩不当，导致第二年就爆发了靖难之役。三年后朱元璋四子朱棣靖难成功，登基为帝，成为明代第三位皇帝，即明成祖。
朱棣去世后他的长子朱高炽继位为帝，成为明代第四位皇帝，即明仁宗。
明仁宗朱高炽又传位于长子朱瞻基，也就是明代第五位皇帝明宣宗。
明宣宗朱瞻基传位于长子朱祁镇，朱祁镇也就成为了明代第六位皇帝，即明英宗。
明英宗朱祁镇在位期间发生了著名的土木堡之变，英宗被瓦剌人俘获后，明朝拥立朱祁钰为帝，也就是明朝第七位皇帝明代宗。
明代宗朱祁钰是明宣宗朱瞻基的次子，也是明英宗朱祁镇的同父异母弟。所以土木堡之变是继靖难之役后又一次影响明朝皇帝血缘关系的事件。
后来明英宗在明代宗病重期间通过夺门之变重新登上帝位，这样一来明代帝位血脉就又回到明英宗朱祁镇这一支。
明英宗后传位于长子朱见深，朱见深成为了明代第八位皇帝，即明宪宗。
宪宗传位于三子朱佑樘，朱佑樘成为了明朝第九位皇帝，即明孝宗。明孝宗是历史上著名的只有一个老婆的皇帝。
孝宗后传位于长子朱厚照，也就是明朝第十位皇帝，明武宗。
武宗去世时未留下子嗣，而孝宗又没有其他儿子在世，因此只能从近支中选择皇位继承人，最终选定了孝宗弟弟的儿子朱厚熜继承皇位。朱厚熜也就是明代第十一位皇帝，即明世宗。
世宗后传位于三子朱载垕，朱载垕即明代第十二位皇帝，明穆宗。
穆宗后传位于三子朱翊钧，也就是明神宗万历皇帝，明朝第十三位皇帝。
神宗后传位于长子朱常洛，朱常洛成为明代第十四位皇帝，即明光宗。
光宗后传位于长子朱由校，朱由校就是明朝第十五位皇帝，明熹宗。
熹宗原有三个儿子，但都早夭，之后继承皇位的是明光宗的五子，也就是明熹宗同父异母弟朱由检。朱由检也就是明朝最后一位皇帝明思宗崇祯皇帝。明朝十六位皇帝的血缘关系至此都已说清。