吉林省安全生产教育中心设有多个部门，以确保高效运营和专业服务。以下是各部门的主要职责：
1. 办公室: 负责日常办公的组织和协调，包括制定工作规则、起草文件、管理文秘事务、接待工作、会议筹备、人事管理、财务和资产管理工作，以及后勤和安全保卫、党务和工会共青团工作。
2. 培训一科: 专司全省非煤矿山企业的安全管理培训，包括监督管理人员、主要负责人、安全管理人员和特种作业人员的培训，教师培训，注册安全工程师的继续教育，理论研究，培训计划制定，教师组织与管理，培训大纲编写，教材选定和发行，以及教学评估。
3. 培训二科: 专注于煤矿行业，负责煤矿矿长及特种作业人员的培训，同样进行理论研究、培训计划制定、教师管理、大纲编写、教材工作和教学评估。
4. 考核科: 受省局委托，负责各类人员的考核，包括考核题库建设、标准制定、档案管理，以及相关证照的制作和发放。
5. 宣传教育科: 负责安全生产的媒体宣传工作，包括与国家级和省级媒体的合作，以及宣传教育产品的研发和发布。
6. 招待所: 管理中心的宾馆、招待所和食堂，提供学员接待服务。