哈尔滨医科大学作为国务院学位委员会首批批准的学位授予单位，自1978年我国恢复研究生招生制度以来，其研究生和学位教育发展迅速。自那时起，学校致力于以学科建设为核心，本科教育为基石，积极推动研究生教育和长学制医学教育的发展，以适应国家医药卫生事业及经济建设的需求。
学校的办学理念是培养具有创新精神的医学人才，产出高水平科研成果，并提供优质医疗服务，旨在建设成为中国一流的、在国际上有影响力的教学研究型医科大学。在实施这一指导思想的过程中，学校秉持实事求是的精神，勇于创新，把握机遇，不断深化改革，推动教学、医疗和科研的整体水平与综合实力不断提升，展现出了积极向上的发展态势。