1762年，卢梭先后出版了《社会契约论》和《爱弥尔》等书。《社会契约论》提出了一个民主平等的社会原则，认为国家的建立是人们协调一致而订立契约的结果，因此人民有权掌握国家的政权。卢梭的这个民主精神，彻底地表现了资产阶级民主原则，为以后的法国大革命的领袖们提供了主要的政治思想，也影响到美国的资产阶级革命。
《爱弥尔》是卢梭半小说体裁的教育名著。在这本书中，卢梭通过对他所设想的学生爱弥尔的教育，竭力反对封建教育，系统地阐述了他的自然教育的观点。在书中，他不仅尽情地攻击了封建政权，还尽情地抨击了教会，因此遭受迫害，他的书被判为禁书并在巴黎广场当众焚毁，本人也受到通缉，被迫逃往国外。晚年卢梭怀着悲愤的心情完成了他的自传《忏悔录》，坦率地总结了自己一生的经历和思想抱负。1778年7月2日因中风而与世长辞，终年66岁。