这个不一定，因为还没做彻底的检查，也不知道情节严重程度。但稽查局是立案检查，不会马马虎虎的例行公事的。一般是专管员觉得你们公司有什么问题，税务、财务报表出现很明显的漏洞，才会上报，稽查局才来查账的。稽查局肯定比税务局查账要严格。会要求你提供公司的原始凭证、记账凭证、报表等资料。立案后的案件，不管从监督督查机制，还是从各环节的分工明确都要强过管理局的评估，所以，稽查局肯定会认真的检查。
查税的基本程序是：
一、选案：根据案源信息筛选，决定是否立案
二、立案
接下来，如果符合条件就要进行立案，立案之后就是检查程序，根据检查结果制作《税务稽查报告》。实施检查之日起60日内完成，确需延长检查时间的，应当经稽查局局长批准。
最后就是审理程序，检查完毕，检查部门应当将《税务稽查报告》、《税务稽查工作底稿》及相关证据材料，在5个工作日内移交审理部门审理，并办理交接手续。
审理部门接到检查部门移交的《税务稽查报告》及有关资料后，应当在15日内提出审理意见，但下列时间不计算在内：
（一）检查人员补充调查的时间；
（二）向上级机关请示或者向相关部门征询政策问题的时间。
案情复杂确需延长审理时限的，经稽查局局长的批准，可以适当延长。
法律依据
《中华人民共和国税收征收管理法》
第十九条纳税人、扣缴义务人按照有关法律、行政法规和国务院财政、税务主管部门的规定设置帐簿，根据合法、有效凭证记帐，进行核算。
第二十条从事生产、经营的纳税人的财务、会计制度或者财务、会计处理办法和会计核算软件，应当报送税务机关备案。
纳税人、扣缴义务人的财务、会计制度或者财务、会计处理办法与国务院或者国务院财政、税务主管部门有关税收的规定抵触的，依照国务院或者国务院财政、税务主管部门有关税收的规定计算应纳税款、代扣代缴和代收代缴税款。
第四十四条欠缴税款的纳税人或者他的法定代表人需要出境的，应当在出境前向税务机关结清应纳税款、滞纳金或者提供担保。未结清税款、滞纳金，又不提供担保的，税务机关可以通知出境管理机关阻止其出境。
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