一宅两户可以分别确权、解决纠纷后再确权、两户协商后再确权。
1、分别确权
一处宅基地，住了两户，那么两户可以共同协商，确定各自的宅基地面积，意见达成一致之后，分别将确定的面积确权在自己的名下。
2、解决纠纷后再确权
一处宅基地住了两户，各自不知道自己的面积有多少，协商也达不成一致意见，在各不相让的前提下，就属于民事纠纷了。在这种情况下，只有先不确权，待待纠纷解决后予以确权登记。
3、两户协商后再确权
两户在协商后一户确权，另一户放弃确权。农村村民一户只能拥有一处宅基地，其宅基地的面积不得超过省、自治区、直辖市规定的标准。一户只能拥有一处宅基地，两户可以拥有两处宅基地，那么一宅两户的，两户可以在一起协商，一户对现有宅基地进行确权，另一户放弃确权，确权的那一户可以给放弃确权的那一户适当的补偿。
宅基地确权的注意事项
1、依法对建房行为进行规范，实行建新拆旧，及时办理相关登记手续。
2、禁止向违法用地户或不符合条件的申请人发放宅基地证书。
3、申请宅基地时，应向村委会提交申请，并由村委会报乡镇审核、登记、备案。
4、宅基地使用权应按照一户一宅原则，面积不得超标。
5、登记程序要规范，颁证之前要公告，资料要齐全，责任要明确。
6、要及时进行公示和登记，遵循先申请后颁证的原则，对批准的宅基地申请，要在20个工作日内完成公示和登记，并核发证书。
以上内容参考：百度律临-农村宅基地一宅两户怎么确权
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