1、入学方式不同
单证在职研究生是先入学后考试。学员可先进入高校参加在职研修班学习，后期符合条件的学员可以报名申硕考试；而双证在职研究生是先考试后入学，学员需要先报名12月联考，联考过线且复试通过被录取之后，才有资格进入学校学习。
2、考试难度不同
单证在职研究生5月同等学力全国统考是合格制，考试只考两门：外语和学科综合，一般通过率在70%左右。
双证在职研究生12月联考结束之后，还有学校的复试。整个考试为选拔制，择优选拔，分考的越高越能被录取。考试一般是4门：公共课英语和政治和两门专业课，有的专业公共课是数学，一般考试通过率在30%左右。
3、报考专业不同
单证在职研究生主要为一些学硕专业，包括哲学、经济学、法学、教育学、文学、历史学、理学、工学、农学、医学、军事学、管理学、艺术学和医学专业学位。双证在职研究生主要是专硕专业，但2018年也增加了不少学硕。
单证在含金量方面不如同等的双证在职研究生，但单证同样受到社会和工作单位的认可，与双证享有同样的法律权益，对于升职加薪评职称都是有很大的帮助。
单证与双证相比，享有同样的法律权益，并没有特殊的限制。
扩展资料：
在职研究生报考条件
五月同等学历在职研究生报考条件
1、本科、学士学位满3年。
2、本科无学位的学生可直接报名研修班进行学习，但想要申硕需满足本科、学士学位满3年的条件。
一月在职研究生报考条件
1、有本科毕业证书和学位证书；专科有两年工作经历的人员。
2、专科毕业5年，本科毕业3年，已获硕士及博士学位满2年后可报考（年限以当年考生入学时间为截止点计算）。
十月在职研究生报考条件（2016年与统招研究生合并共同招生）
1、在职，工作3年或以上。
2、有本科毕业证书和学位证书。
（根据《关于2014年招收在职人员攻读硕士专业学位工作的通知》十月在职研究生报考形式已经取消并入到一月联考之中）。
参考资料：百度百科-在职研究生