不会。二建资格证是通过考试取得，是长期有效的，二建资格证需要注册才能执业，初始注册时间为取得资格证书三年以内，三年不注册就需要满足继续教育条件才能执业。
二建资格证三年不注册不会失效，因为二建资格证书是长期有效的，二级建造师资格证书需要注册才能以二级建造师名义执业，初始注册时间为取得资格证书三年以内，逾期未初始注册的，需要符合继续教育条件方能注册执业。
二级建造师注册证书有效期只有三年，三年期满未延续注册，则注册证书失效，但是资格证书是不会失效的。
二级建造师证书注册条件：
(一)经考核认定或考试合格取得资格证书;
(二)受聘于一个相关单位;
(三)达到继续教育要求;
(四)没有以下所列情形。
申请人有下列情形之一的，不予注册：
(一)不具有完全民事行为能力的;
(二)申请在两个或者两个以上单位注册的;
(三)未达到注册建造师继续教育要求的;
(四)受到刑事处罚，刑事处罚尚未执行完毕的;
(五)因执业活动受到刑事处罚，自刑事处罚执行完毕之日起至申请注册之日止不满5年的;
(六)因前项规定以外的原因受到刑事处罚，自处罚决定之日起至申请注册之日止不满3年的;
(七)被吊销注册证书，自处罚决定之日起至申请注册之日止不满2年的;
(八)在申请注册之日前3年内担任项目经理期间，所负责项目发生过重大质量和安全事故的;
(九)申请人的聘用单位不符合注册单位要求的;
(十)年龄超过65周岁的;
(十一)法律、法规规定不予注册的其他情形。
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