自贸区进出口报关流程主要包括以下几个步骤：
1. 准备资料：进出口企业需要准备包括合同、发票、装箱单、提单等相关文件，以及商品品名、规格、数量、金额等信息。
2. 报关申报：企业根据准备的资料，通过电子报关系统进行报关申报，包括填写报关单、提供相关证书、申报关税税则、征免情况等信息。
3. 报关查验：海关会对进出口货物进行查验，包括检查货物实际情况与报关单信息是否一致、检验商品品质和质量等。
4. 审核放行：海关根据实际情况审核进出口货物的合规性，包括核对报关单信息、税费缴纳情况、货物是否存在违禁品等，审核通过后会放行货物。
5. 缴纳进口税费：根据报关单的税费计算，企业需要缴纳相应的进口税费。
6. 清关出仓：经过海关审批和缴税后，货物可以开始清关，包括办理提货单、清单及签章等手续，提货出仓。
7. 贸易结算：根据合同约定，进口货物的支付和结算。
需要注意的是，具体的报关流程会因地区、货物属性和海关要求等因素有所差异，企业在报关前应了解相关规定和要求。