肺炎应与下列疾病进行鉴别：
(1)干酪性肺炎结核病常有低热、乏力、纳差、盗汗、消瘦等表现，痰中可找到结核菌。X线片病变多在肺尖或锁骨上下区域、呈现密度不均的斑片状渗出或条索状阴影、经久不消散，可形成空洞，易在肺内播散。抗生素治疗无效。
(2)其他病原体引起的肺炎革兰阴性杆菌肺炎多见于体弱及有慢性心、肺疾病或免疫缺损患者，多为院内继发感染。葡萄球菌肺炎和克雷白杆菌肺炎的临床表现均较严重，中毒症状明显。痰、血的细菌培养有助于诊断。支原体分离和血清免疫学试验对诊断支原体肺炎和病毒感染有重要意义。
(3)急性肺脓肿初期临床表现与肺炎球菌肺炎相似。但在病程10～14天，患者有大量脓臭痰为肺脓肿的特征，X线显示空腔和液平。常见致病菌有金黄色葡萄球菌、克雷白杆菌及其他革兰阴性杆菌和厌氧菌。
(4)肺癌肺癌一般不发热或仅有低热，白细胞不高，痰中找到癌细胞或气管镜检可以确诊。并发阻塞性炎症时经抗感染治疗炎症消退，但肿瘤征象更加明显。
(5)其他疾病肺炎伴有胸痛时，需与肺梗死、渗出性胸膜炎鉴别。肺梗死有静脉血栓形成的基础，咯血较多见，多无口唇疱疹。胸腔积液X线有其特征。下叶肺炎出现腹部症状，应与膈下脓肿、胆囊炎、胰腺炎等进行鉴别。