最新的模拟器自带的金手指是肯定可以修改（因为以前的版本我没试过）
1、选好游戏>进入游戏
2、按ESC返回模拟器控制窗口
3、选择【Debug】中的【信息转储】
4、在窗口的下半部分 是输入金手指的区域 输入完 点右下的【生效】键 点【关闭】键推出。
5、点【Paly】中的运行 继续游戏
（注：支持XP4/RAW/AR2码...... 金手指输入时前8位输入在地址栏后8位输入在数据栏。多码的就自己耐心的输入 每输完1条完整的码后点一次生效 然后继续输入下一条.....如果进入游戏发现修改没成功不要着急，在游戏中切换一下场景，或是需要读取的操作，就可以实现修改了，前提是金手指要输入对哦 ）
运行游戏的话
1、打开PS2模拟器在第3栏中单击选择光驱【奥特曼格斗进化3】，再点确定
2、单击【PALY】中的运行来运行游戏
（注意：要运行游戏不要用【GO】里的【引导开始】！）
参考资料：http://bbs.romman.net/thread-120986-1-1.html