可以使用windows系统自带的删除卷来删除分区，待分区删除后，再使用新建简单卷来重新分配U盘空间，使U盘重新合并为一个完整分区。
具体步骤如下：
1、打开计算机磁盘管理，选择需要合并的U盘分区，右键点击该分区，选择“删除卷”；
2、在弹出删除卷的警告窗口，直接点“是”进行确认删除；
3、待删除卷成功后，刚才的磁盘分区变成了未分配空间,
4、使用同样的方法将另一个U盘分区也一并删除，这样整个U盘就成了一个的未分配整体空间。
5、下面对这个未分配空间进行重新分区，右键点击该未分配空间，在弹出菜单中选择“新建简单卷”；
6、windows系统会调用新建简单卷的向导，根据向导的引导，首先维护新卷的大小（默认最大），点击下一步；
7、接下来，为新磁盘分区分配一个未使用的盘符，比如E:，继续下一步；
8、接下来，为你的新磁盘分区命名，如“我的新U盘分区”，继续下一步；
9、最后确认完成新建简单卷的流程，点击完成即可。
10、等待格式化完成后，回到磁盘管理，就可以看到出现了一个新的U盘分区。
下载数据恢复工具（这里以EasyRecovery为例）；打开EasyRecovery后选择恢复的内容类别；选择扫描位置为插入电脑中的U盘，点选左下方的【深度扫描】；等待扫描完成后就会显示出能够在U盘中恢复的文件；勾选文件之后右键点击恢复就可以将文件恢复。以下是详细介绍：
1、首先在电脑上搜索下载数据恢复工具（如EasyRecovery），下载到电脑上安装；
2、将需要恢复文件的U盘插入电脑的USB接口处；
3、打开您刚刚下载安装好的恢复软件，下面以【EasyRecovery】这款软件为例，进入后需要先选择恢复的内容类别，然后点击下一步；
4、在【选择位置】的页面，选择我们的U盘，点选左下方的【深度扫描】，耗费时间更久但也有更大的几率能够找到被误删除的文件；
5、等待扫描完成后就会显示出能够在U盘中恢复的文件；
6、选择需要恢复的文件，然后右键点击恢复，根据提示选择恢复的路径即可将文件恢复。
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一、U盘可以分区么？
回答是肯定的。U盘可以进行分区。但需要有专门的工具软件。
一种情况是，某些U盘芯片对应的量产软件可以对U盘进行分区，但这种情况具有高度针对性，某个量产工具只针对某个U盘芯片型号。没有普遍适用性，所以对U盘分区及U启问题意义不大。
推荐大家使用这个工具：
BOOTICE.EXE
插入移动设备
运行这个软件
软件界面上可以看到：格式化分区，点击这个按钮
在下一个界面，会看到多个分区模式：
USB-FDD模式
USB-ZIP模式
USB-HDD模式（单分区）
USB-HDD模式（多分区）
选用最后这个模式，可以对U盘进行多分区操作，并且这里可以随时把某个U盘分区设置为可见或者隐藏
二、U盘分区都是可见的么？
已经对U盘进行分区的，会发现一个问题，在Windows系统下，U盘不像硬盘那样每个分区都可见。只能显示一个盘符，实际上没有可见的分区是正常的，没有丢失或者坏掉。
这是什么原因？是分区软件或者量产软件的原因么？
不是。其唯一原因是Windows系统。对于U盘，仅分区表中的第一个分区在Windows系统下可被使用，显示盘符并且可以正常操作。其它分区不会被显示。
当然，你可以用BootIce这个工具随时把U盘的某个分区设置为可见而能够被操作。
所以，U盘某些分区不可见的问题不要纠结，等到Windows系统认定的理念改变以后，这个问题就不存在了。
三、把U盘分区后，让U盘上的不止一个分区都成为可启动盘，能够实现么？
可以实现U盘的多系统引导。但这种情况不会出现：
在“一个u盘在BIOS里或快速启动菜单里显示两个启动项目，一个是USB-hdd+，一个是USB-CDROM，分别启动”，这种情况不会出现。
因为每个硬件在底层系统（BIOS系统）中都是作为一个设备挂载的。
你见过一个硬盘作为不同的启动项目出现在BIOS启动选项里的么？没有，所以U盘也不能。
但我们可以使用软件把一个U盘上的不同分区上的不同系统组织在一起，形成一个菜单选项，这样从一个U盘启动后，可以从U盘不同的分区上引导不同的系统。就象从硬盘启动后进入一个菜单选项，可以选择从那个系统引导一样。
推荐使用：
xorldr
用这个小软件，可以很方便地组织U盘上的多个系统
1、点“安装/配置”，可以增加/删除一个启动项，更改启动菜单的颜色、背景图片，可以设置从U盘某个分区启动系统，可以从U盘上的某个扇区启动（你可以把启动代码写入某个扇区），可以从U盘上的某个文件启动
2、可以随时用这个工具点：“重建MBR”，把U盘启动恢复到普通模式
3、它支持的启动类型包含平时我们所见的Windows启动，还有更多：PBR、GRLDR、NTLDR/BOOTMGR、SYSLINUX、MS-DOS、Free-DOS、IMG镜像等等
概括一下，只要你想用U盘做启动，想对U盘进行分区，不需要什么教程，只需要记住以下两个小软件的文件名，找到这个软件，使用很简便，都是中文界面，是U启/启动盘高手的杰作，用这两个软件不需要用芯片精灵Chipgenius查看U盘芯片，它适用与任何芯片的U盘，对移动硬盘同样适用；顺手用来，轻松搞定U盘分区与启动。
补充问题：
量产U盘后一个U盘显示为两个磁盘，一个正常使用，另外一个是多余出来的，怎么变成正常的一个磁盘呢？
用xorldr重建U盘的MBR即可
量产U盘后想收回分区，或者制作U盘启动后想恢复原来的状态，怎么办？
用BootIce重新格式化U盘为一个分区即可；用xorldr重建U盘的MBR即可
推荐另一个U盘利器：Fbinstool
用它可以把分区制作成启动盘，不用象量产软件那样，针对某个芯片而言，它适用所有的U盘，存储卡、移动硬盘等
用Fbinstool收回U盘分区的方法是：
运行Fbinstool，点格式化，勾选强制格式，普通模式，一会儿完成格式化，安全弹出、重新插上U盘即恢复正常状态。
1、插入U盘。
2、按windows键，右键点击运行，再左键点击以管理员身份运行。
3、输入diskpart,按enter。
4、输入list disk,按enter。
5、之后会看到
disk 0
disk 1
6、如果电脑磁盘分过区的话可能还有disk 2 、 disk 3等。
7、输入select disk X(X代表磁盘后面的数字0、1，可磁盘的大小来判断数字是多少，一般是1),按enter。
8、输入clean，按enter。
9、以上完成之后，到“磁盘管理”选择U盘，新建简单卷，并重命名U盘。
今天我就把这个问题彻底解决了：
1、下载一个叫DiskGenius的分区软件；
2、运行该软件就会看到U盘的分区信息（当然你得先把U盘插入电脑）；
3、点击快速分区按钮，会看见需要修改分区数目，则在“自定”的后面选1；
4、然后点确定按钮；
5、此时会提醒，原有分区被删除，新分区将被格式化（这正是你想要的，有木有？）
6、确定
大功告成，记得给分哟！本回答被提问者采纳