一、含义不同
“3+2”专本贯通就是指专科生在专科院校校读到大三的时候，报名参加至少是省一级的统招考试，如该生被本科院校录取，就可以在那个学校读书两年。两年之后，该生就可以拿到该本科院校的文凭，为第一学历。
专升本，是指普通高职（专科）院校的学生结束专科阶段的课程学习后，根据当年教育部和国家发改委编发招生计划，由各省级教育行政部门组织实施的一项标准化选拔性考试，选拔的对象是应届普通全日制（统招入学）的高职（专科）毕业生。
二、考试形式不同
专本贯通是考生通过高职分类考试进入专科院校，然后再通过转段考试进入对应的本科院校。
普通高校“专升本”考试按文、理科两个大类组织考试。
三、学校数量不同
与专本贯通不同，专升本选择面更大。专本贯通只涉及6所专科学校和6所本科学校，而原则上，所有专科学校都可以专升本，本科院校选择也更多。参加专本贯通的同学以后仍可以选择专升本，多一个选择机会；但如果错过专本贯通，以后就只能选择专升本。
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