睡眠的时间是由我们体内的生物钟控制的。睡眠和清醒在某一时段内处于动态的平衡中。生物钟是由相关的酶控制的内在定时装置，这些酶与体内一种神经递质——腺苷协同作用，后者会抑制体内许多与清醒相关的生理过程，引起睡眠。体核温度（身体深部的温度）、体内褪黑素的水平以及血浆皮质醇的浓度是生物节律性的三个重要指标。概括来讲，降低体内温度有助于入睡，强光会抑制褪黑素分泌而影响入睡，早上的日光对生物钟有调整作用。在昼行性动物如人类中，当生物节律的要素引起下丘脑垂体松果腺中褪黑素的释放以及体核温度逐渐降低时，身体会进入睡眠状态
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