南京大学好一点。
南京大学和中科大都是超越985高校的C9联盟高校。教育部评估中，南大在C9中排名第三。实力和底蕴要比北航强很多。
南京大学主要是偏文，理科的，不擅长工科。但也是相对不擅长，文，理能排到柜内前5。工科能到前15。像计算机专业是在国内前十的。
唯一的缺点是不在北京这样的一线城市，没有科技的氛围和一线城市的医疗，教育和科技产业的福利。
中科大的计算机一定是相当好的，是中科院直属院校，纯理工类大学，学术氛围浓厚。适合搞研究。优点是利于出国深造，比清华要出国容易，受国外学校认可。缺点是地处偏僻，比南京大学更偏。
北航最大的优点是地理优势，就是在北京，受北京强大财力，人力的支撑，计算机实力在清华之下。本身没什么说的，就是名气好。
其实所有的学校就名气最重要，实力不一定最好，这个学校类似北邮，都是在一定实力的基础上，占据首都的优势，造出名气，引来优秀学子，和知名企业，在不断反馈，壮大学校。
对工科有兴趣推荐浙大上交吧，浙大农学院很好，而且规模优势很明显，之后还是有上升趋势。上交工科垄断东南沿海的资源。
希望自己能全面发展的，还是建议来文理并重，计算机软件水平一流的南大好啦。
认识很多科大的同学，交流的时候发现他们的基础学科“理论确实非常扎实。我自己最近在学机器学习相关，发现很多里面的理论都离不开概率论。
但是科大问题同样很突出，和同学聊的时候感觉他们本科四年跟读了高四高五高六一样，如果成绩不是前百分之十五左右的同学读完会有很多失落感，本来来了后就和自己理想的大学生活有一定落差，再加上成绩又被虐不是特别突出，心里难免不平说到底都是万恶的优秀率啊。
天地交融阴阳互补，人文环境的养成总离不开两性的共同努力吧而且我个人觉得本科是人生发展的重要阶段，本科教育是教一个人怎么成为人，而不是教一个人怎么成为一个合格的工具，所以本科去一个人文环境好的环境很重要。
南京大学与中科大的优势：
南大的优势就是学科综合，文理信息技术并重，这带给我的另一个宝贵的精神财富就是认识了很多别的专业的同学，学习了很多别的院系的知识，听了很多交叉学科%的讲座。以前经常跟软院计科的同学吃饭聊天。
也是那时候我认识到了神经网络%，机器学习，知道了很多目前人工智能的前沿。有时候会和地科的同学爬山野营，途中会跟我进很多地理地质方面的知识。有些公选课会和医学院生科的同学分到一组，做小组作业时学到了很多养生知识。