法律分析：个税计算公式：
应纳税所得额=月度收入-5000元(免征额)-专项扣除(五险一金等)-专项附加扣除-依法确定的其他扣除。
假设我们收入一万元，每月社保公积金个人缴纳1000元，专项附加扣除1000元，扣除起征点的5000元，那么每月的应纳税所得额就是：10000-1000-1000-5000=3000元，一年就是36000元。
关于专项附加扣除这一项，这也是国家为降低个人所得税缴纳负担而采取的一项惠民措施。具体来说，如果纳税人有子女教育、继续教育、大病医疗、住房贷款利息、住房租金以及赡养老人等六项专项费用支出，那么这部分费用还可以排除在计税范围之外。
扣除起征点的五千元，剩下的五千元也并非全部计算个税，还需要扣除五险一金的个人缴纳部分，以及其它专项附加费用，然后才是计税金额。
法律依据：《中华人民共和国个人所得税法》 第二条 下列各项个人所得，应当缴纳个人所得税：
（一）工资、薪金所得；
（二）劳务报酬所得；
（三）稿酬所得；
（四）特许权使用费所得；
（五）经营所得；
（六）利息、股息、红利所得；
（七）财产租赁所得；
（八）财产转让所得；
（九）偶然所得。
居民个人取得前款第一项至第四项所得（以下称综合所得），按纳税年度合并计算个人所得税；非居民个人取得前款第一项至第四项所得，按月或者按次分项计算个人所得税。纳税人取得前款第五项至第九项所得，依照本法规定分别计算个人所得税。