据实践，有机肥有以下五个特点：
①有机肥施入土壤，经微生物分解，可源源不断地释放出各种养分供植物吸收，还能释放出二氧化碳，改善作物碳素营养；
②有机肥在分解过程中，产生腐殖质，胡敏酸、氨基酸、黄腐酸等，对种子萌发，根系生长均有刺激作用，促进了作物生化代谢；
③有机肥是改良土壤的主要物质。微生物在分解过程中生成分泌酶，腐殖质，调节土壤物质和进行能量转化，促进土壤团粒结构形成，增强土壤保水保肥能力；
④有机肥可提高土壤难溶性磷的有效性；
⑤可增加产量和改善品质。有机肥配施适量化肥，能提高抗逆能力，可大大提高商品率。
2、能生产可出售的产品
3、改善土地利用
4、降低污染和卫生风险，
5、杀死病原菌
6、使用有机肥作为养殖垫料
7、抑制病害以及获得补贴。
1.无污染，无公害，生物复合肥是天然有机物质与生物技术的有效结合。为作物制造或转化速效养分提供“动力”。
2.配方科学，养分齐全。除了一些微量元素外，还有大量的有机物质，腐殖酸类物质和保肥增效剂，养分齐全，速缓相济，供肥均衡，肥效持久。
3.活化土壤，增加肥效。生物肥料具有协助释放土壤中潜在的养分的功效。对土壤中氮的转化率达到5-13.6%，对土壤中磷，钾的转化率可达到7-15.7%和8-16.6%。
4.有效提高耕地肥力，改善土壤供肥环境。
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1.增加土壤有机质，有机肥是改良土壤的重要物质，它能改善土壤的物理性质化学和生物活动使土壤肥沃的因素-水，肥料，空气和热量。等等，可以相互协调，更好地满足生长的需要。
2.改善土壤结构，在有机肥的分解过程中，一方面有机物被分解和矿化，另一方面，腐殖质释放养分，使一些有机化合物收缩。脱水形成复杂的腐殖质。降解的有机物和新合成的腐殖质，可以改善土壤结构，增强土壤保水保肥的能力，它还能提高地温，改善土壤的可耕性，延长土壤的适宜耕期，提高种子质量对种子发芽、根的生长和植物养分的可用性可以刺激植物的生长，这对植物是有益的。以及体内各种物质的呼吸、光合作用、代谢也有很好的影响力。有机肥形成的腐殖质缓冲能力强，土壤有机胶粒阳离子交换容量大，可以避免局部土壤中肥料浓度过高。对农作物的危害。腐殖酸可以保护植物免受代谢毒性。腐殖酸品质可以明显提高植物的产量和品质。
一、提高土壤有机质含量。
经常施用有机肥能明显提高土壤有机质含量，有利于维持土壤有机质的稳定，改善土壤的理化性状。
二、促进土壤团粒结构的形成。
土壤有机质、碳酸钙和多糖类物质对土壤结构的稳定性有良好作用。施用有机肥比施用厩肥更能增加土壤有机质的含量，尤其是能产生较多的五碳糖、六碳糖和多糖。这特别有利于水稳性团粒的形成，如使大于0.25mm的水稳性团粒明显增加。
三、提供养分。
有机肥中含有作物需要的各种养分，有机肥的使用能明显提高耕层土壤中养分，尤其是钾的含量。1995年农业部对全国12个省份耕地的调查，耕地中磷含量较之1990年以前有所增加，而缺钾和缺微量元素的耕地面积却有所扩大，因此大力提倡秸秆还田有利于部分归还土壤钾素。
四、调节土壤的氮素供应。
微生物在分解C/N大的秸秆初期，要从土壤中吸收氮素组成自身的体细胞，导致土壤氮素的生物固定，起到了暂时保存氮素的作用。当微生物死亡后，这部分氮又分解释放。此外，有机肥的施用增加了土壤中的能源物质，也有利于生物固氮，有机肥料中的有机质含量可达30%左右，相关资料显示，每氧化1.0g碳素释放的能量，可供固氮微生物固定10~40mg氮素的需要。
五、提高土壤微生物和土壤酶的活性。
施用有机肥后微生物的数量明显增加，距离施有机肥处近的土壤尤为明显，这对加速有机态养分的释放，活化土壤中的养分有良好的作用。此外，有机肥还能减少某些作物的病害。
有机肥在农业生产中施用所显示的优点还包括：
1、营养平衡，促进作物生长，增产明显，肥效高；
2、改善农产品品质；
3、抑制病原菌，减轻病虫害；
4、疏松、改良土壤，减少土壤中硝酸盐的污染；
5、增加作物对水分的吸收、增强作物抗旱及抗倒伏能力；
6、经过科学的管理，可使种植的农作物达到国家绿色食品用肥标准“A级”或“AA级”。
