葡萄牙的官方旗帜与军旗有所不同。军旗于1911年启用，规格为1.20米宽、1.30米长的长方形，宽高比为12:13，可根据需要调整尺寸。它的背景色是绿色和红色，各占一半。军旗中央是经过修改的国徽，包括盾牌、浑仪和两枝环绕的黄色月桂枝。旗杆上缠有绿色和红色的缎带，军旗上则为单条白色缎带，上面镌刻了诗人路易·瓦兹·德·贾梅士的诗句「Esta é a ditosa pátria minha amada」，意为“这是我心爱的祖国”。浑仪占旗宽的三分之一，具体尺寸为35厘米宽、45厘米长。
在军事场合，军旗会采用1.25米的金色边缘正方形，放置在长矛形旗杆上，刻有单位名称，饰以红、绿、金缨，用于展示军事单位的荣誉。
葡萄牙海军旗仅用于军舰船首，从日出到日落悬挂，是正方形旗，绿边红底，中央放置小型国徽，浑仪直径占旗宽的七分之三。国旗则在相同时间挂于船尾，同样为正方形，绿边红底，中央也有小型国徽。
在国家高级官员中，葡萄牙总统的旗帜独具特色，以墨绿色为背景，小型国徽居中。总统官邸—贝伦宫和座车通常会悬挂这种旗帜。总理的旗帜为宽高比2:3的白色矩形，绿色X形十字贯穿其中，中央有小型国徽，边缘饰有黄色月桂叶图暗的红色花边。其他部长的旗帜则不包含红色花边。葡萄牙共和国议院的旗帜为绿色边缘的白色长方形，中央同样放置小型国徽，彰显其官方地位。
葡萄牙国旗图案为双直条型，靠近旗杆五分之二为绿色，尾端其馀五分之三为红 色，双条交间处饰有小型国徽（浑仪和葡萄牙盾牌）。该设计替代了葡萄牙王国时期的国旗，并于葡萄牙共和国成立后的1911年6月30日获正式采用为共和国国旗，由葡萄牙画家科伦巴诺·博达洛·平尼艾罗（Columbano Bordalo Pinheiro）、新闻记者兼政治家若昂·沙加斯（Joo Chagas）、及外交家兼作家阿贝尔·波泰略（Abel Botelho）组成的特别委员会从众多候选中确定的。