樱桃属植物有150余种，广泛分布在北半球温暖地带，我国西南各山区种类最为丰富，已经确定的有76个种，但能作为甜樱桃砧木的却为数不多，目前生产上常用的砧木主要有以下几种类型。
（1）中国樱桃
我国普遍采用的一种砧木，分布较广，北起辽南，南至云、贵、川皆有分布，但以山东、江苏、安徽为多，种源丰富，容易采集。适应性强，须根发达，无明显主根，根系分布浅。耐干旱抗瘠薄，但不抗涝，耐寒力差。种子出苗率高，扦插易生根，嫁接成活率高，结果早。中国樱桃实生苗较抗根癌病，但病毒病较重。用健康树作为母树无性繁殖的苗生长健壮，几乎无病毒病症状。目前生产上常用的是普通型中国樱桃和莱阳矮樱桃。
普通型中国樱桃：普通型中国樱桃的栽培品种如大窝娄叶、大红樱桃、诸城黄樱桃等均可作为砧木。大叶草樱桃（中国樱桃的一种类型）较好，它叶片大而厚，叶色浓绿，分枝少，枝粗壮，节间长，根系分布深，须根较少，粗根较多。嫁接甜樱桃后，固地性较好，生长势强，不易倒伏。抗根癌病及病毒病能力较强，寿命长。
莱阳矮樱桃：特点是树体紧凑矮化，为普通型中国樱桃树冠的2/3。根系分布深，固地性强。与甜樱桃嫁接亲和性强，成活率高，有小脚病现象。但据在泰安调查，也有不同程度的病毒病症状表现。因此，进行无性繁殖时，需严格选择母树。
东北山樱：主要分布在辽宁的凤城、本溪、宽甸，吉林的集安、通化等地。高大乔木，树冠半开张，枝条粗壮，生长健壮，结果早。果实红紫或黑紫色。4月下旬开花，6月中下旬成熟。东北山樱做砧木，种子发芽率高，繁殖容易且快，生长势旺，当年可嫁接，嫁接成活率高，一般为70%～90%，嫁接苗及幼树生长健壮，抗旱、耐寒力强，主侧根都较发达，嫁接后3年即可结果。由于其变异类型很多，不同的种类抗病能力差异很大，因此用东北山樱做砧木应注意选择适宜的种苗，以免根癌病、小脚病的发生。造成小脚病的主要原因是砧木与接穗生长发育不一致，砧木生长缓慢，而接穗生长迅速出现上粗下细的“小脚”现象，不耐涝。幼树期间影响不大，进入结果期后，根部向树体输送养分能力不足，会导致树体营养不足而死亡。用东北山樱做砧木时，紧贴根部进行嫁接，可减轻小脚病的发病率。对已发生小脚病的树，可采用桥接的办法来解决。（2）酸樱桃
在我国只有毛把酸一个品种，1881年引入我国烟台芝罘和龙口。现在蓬莱福山等地有零星栽培，邹城市有集中分布。小乔木或丛状灌木，树冠开张。种子发芽力强，出苗率较高。扦插不易生根，但极易产生根蘖，可用根蘖苗繁殖，也可用组织培养苗繁殖。主、侧根发达，耐干旱、抗瘠薄，适应性强。与甜樱桃嫁接亲和力强，并有一定的矮化作用。喜砂质壤土，在黏土地上较易感根癌病和流胶病。（3）考特（Colt）
1958年英国东茂林试验站用甜樱桃和中国樱桃杂交育成，1977年作为半乔化砧推出，20世纪80年代引入我国。扦插容易生根，主要靠扦插和组织培养繁殖。须根发达，生长旺盛，干性强。考特砧甜樱桃在烟台及临朐一些区域生长结果良好。（4）马扎德（Mazzard）
甜樱桃的野生种，是北美地区应用最普遍的甜樱桃砧木。通常用种子繁殖，砧苗根系发达，叶片大，生长旺盛，树势强健。与甜樱桃嫁接亲和力强。用马扎德作砧木嫁接的树体寿命长，产量高，耐瘠薄、耐黏重土壤、耐旱、耐湿，对根腐病具有一定抗性。主要缺点是树冠大、进入盛果期晚、根系浅、易感染根癌病等。（5）马哈利（Mahaleb）
原产于欧洲中部地区，为欧美各国广泛采用的甜、酸樱桃兼用砧木，18世纪欧洲开始用做砧木。
乔木，株高3～4米，树冠开张。枝条细长，分枝多。叶小，圆形或卵圆形，革质，有光泽。花白色，总状花序。果实小，球形，紫黑色，离核，味苦涩，不能食用。
马哈利樱桃多用种子繁殖，萌芽率高，砧苗生长健旺，播种当年可供嫁接，嫁接亲和力较强。虽属乔化砧，但嫁接甜樱桃时砧木干留高些有一定矮化作用，树冠比马扎德为小，结果早，丰产。根系发达，多向下伸展，抗旱，耐瘠薄，不耐涝，在黏重土壤中生长不良，比较适应于轻壤土中栽培。耐寒力很强，在-30℃气温下不受冻害，在土温-16℃虽有冻害但也不致死亡。（6）吉塞拉（Gisela）
吉塞拉（Gisela）系列矮化砧，原产德国，具有矮化、早实、丰产、抗病、抗寒、耐涝等优点。山东省果树研究所从美国引进。
20世纪60年代德国Giessen市Justus Liebig大学的Wer-ner Grupe等以酸樱桃、甜樱桃、灰毛叶樱桃、灌木樱桃等几种樱桃属植物进行种间杂交，获得6000余株杂种实生苗，从中选出多个性状优良的无性系甜樱桃矮化砧，称吉塞拉（Gisela）系列。1987年美国和加拿大成立NC-140砧木种植试验区域协作网，对引进的17个吉塞拉（Gisela）系列无性系进一步加以筛选，到1995年筛选出4种在生产中推广应用，以其为砧木的甜樱桃植株均表现矮化紧凑、早果丰产、抗病性强，单株苗价比普通马扎德或马哈利砧木苗高3美元以上。
德国育成的吉塞拉系列无性系甜樱桃砧木，具有抗病、矮化、结果早等优点，能使树体矮化30%～50%，结果期提前2年，适合密植栽培和设施栽培，与甜樱桃嫁接亲和力强，适应性广，从根本上解决了甜樱桃发展的砧木问题，世界各国正在大力推广。
国外吉塞拉矮化砧木多采用压条和扦插繁殖，但采用常规方法繁育吉塞拉系列砧木苗，繁殖系数低，成苗慢。采用组培快繁技术，繁殖系数大大提高，可在短期内大规模应用于生产，这对提高我国甜樱桃栽培的产量、效益、规模，将产生巨大的推动作用。