公共资源交易中心和行政审批服务中心二者不在一个系统内，其级别一般在本级或副级财政全额拨款的机构内。由于他们不是一个系统，没有层级关系，只有可能是互补关系。
公共资源交易中心公共资源交易中心是负责公共资源交易和提供咨询、服务的机构，是公共资源统一进场交易的服务平台。
内容包括工程建设招投标、土地和矿业权交易、企业国有产权交易、政府采购、
公立医院药品和医疗用品采购、司法机关罚没物品拍卖、国有的文艺品拍卖等所有公共资源交易项目全部纳入中心集中交易。
公共资源交易中心的特点在逻辑上将管理与服务进行统一管理。
由于采购法和
招投标法中有着部分法律条文的冲突，导致在交易平台中出现了若干问题，故而以公共资源交易中心为试点，提供现实法律依据的来源，同时公共资源交易中心的建立多以事业单位的形式出现，在未来四年内，事业单位改革将何去何从，也是公共资源交易中心即将面对的问题。
行政服务中心行政服务中心原名行政审批服务中心，又叫
政务服务中心 ，是集信息与咨询、审批与收费、管理与协调、投诉与监督于一体的综合性行政服务机构。《关于深化政务公开加强政务服务的意见》中指出，要逐步建立健全政务服务体系，要充分发挥服务中心（即政务（行政）服务中心）作用 。
行政服务中心创建的目的行政审批服务中心的建设以便民、高效、廉洁、规范为宗旨，推行“一站式办公、一条龙服务、并联式审批、阳光下作业、规范化管理”的运行模式。
1、集中办事，方便群众
具有行政审批职能的部门在中心设立窗口集中办公，将行政相对人需要跑多个部门才能办成的事，变为只跑中心一处就能办成，极大地方便了办事群众。“变群众跑为干部跑”，“变外部跑为内部跑”，真正体现了以民为本的思想和为民服务的宗旨。
2、加强监督，提高效率
在中心的统一要求、组织、监管和协调下，对进入中心的所有审批事项都作出公开承诺、限时办结；特别是通过并联审批，切实简化了办事程序、有效提高了办事效率。同时，通过各单位之间、窗口工作人员之间的相互监督，中心管理人员和社会公众相结合的监督，使监督工作更好地落到实处。
3、阳光作业，防止腐败
建立公开、透明的告知制度，服务项目、受理条件、办事程序、办结时限、收费项目、收费标准、办事结果、行为规范、管理规章等全面公开，实行阳光作业，保障了行政相对人的
知情权，保证了行政审批的公正与规范，有效地预防和减少了暗箱操作、权力寻租、“
吃拿卡要”等腐败现象的发生，改善了政府及其部门的形象。
4、规范收费，有利财政
严格按规定标准收费，减少了部门自由裁量收费数额的随意性，全部收费直接进入财政统一账户，透明了各部门资金状况，方便了财政对各部门资金的有效监管，防止了资金流失，保证了
财政收入。同时，扩大了
财政资金的调度空间，并为减小部门收入差距提供了方便。