（1）胰腺脓肿：胰腺脓肿是急性胰腺炎最严重的并发症，一旦确诊应争取尽早手术，因为其自然病程的病死率几乎达到100%，及时进行手术和全身处理可使病死率降至5% ～ 13.9%。手术时应特别注意清除胰体和胰尾的后方、升结肠后方和小肠系膜根部等处的感染灶，清除后还应放置大口径引流管。
胰腺脓肿的手术方法较多，大致可分为三类：①单纯引流术；②正规感染灶切除术；③清创术和开放引流术。近10 年来，这种手术的应用大大增加，主要原因是其可使感染坏死物不断排出，使病死率降至11% 左右。
（2）胰腺假性囊肿：由胰腺坏死引起的假性囊肿的危险系数较大，囊肿形成后出现压迫症状或囊肿直径超过5 _者均须积极治疗，包括手术。手术指征为囊肿出血、体积迅速增大或感染与破裂等。手术时机以发病6 周后为宜，因为囊肿成熟期至少需要6 周，且40%的囊肿有可能在6 周内自行消退。手术方法是通过内外引流术使囊肿因有效减压而迅速缩小，囊腔塌陷，最终闭合。
（3）胰腺出血：胰腺出血大多须采取手术治疗，手术止血时应结扎有活动性出血的血管主干，如果是因脾静脉血栓和胃区静脉曲张造成的静脉出血，则可考虑行脾切除术。出血量大时首选手术方式为胰腺切除术，已行胰腺切除的患者则应考虑结扎出血的血管。
（4）消化系统并发症：严重的急性胰腺炎炎症可波及胰周组织，造成胃肠组织缺血和坏死，严重时还可造成胃、十二指肠、空肠、回肠或结肠等穿孔。治疗时以切除坏死的胰腺为主，小肠穿孔时可考虑行小肠切除及肠管端端吻合术，结肠穿孔则应先造瘘，以后再进一步处理。
（5）远期并发症：急性胰腺炎治愈后，有时会出现反复发作的局部炎症和急性期后滞留的各种问题，此时可考虑手术治疗。
若存在胆总管末端小结石、胆胰管囊肿、胰腺癌、肝胰壶腹狭窄、副胰管狭窄梗阻等先天性畸形等问题，也可进行手术治疗。对于这些患者，过去大多主张在急性症状消失后的6 周至3 个月施行手术，近年来则倾向于急性炎症未消退时就应尽早手术，以防急性胰腺炎复发。